معلومة

15.21C: الجراثيم البولي التناسلي الطبيعي - علم الأحياء

15.21C: الجراثيم البولي التناسلي الطبيعي - علم الأحياء


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

تتكون البكتيريا المهبلية في الغالب من أنواع مختلفة من العصيات اللبنية.

أهداف التعلم

  • تعرفي على أنواع البكتيريا الموجودة في البكتيريا المهبلية

النقاط الرئيسية

  • إذا زاد عدد الميكروبات عن نطاقاتها النموذجية (غالبًا بسبب ضعف الجهاز المناعي) أو إذا كانت الميكروبات تسكن مناطق غير نمطية من الجسم (مثل سوء النظافة أو الإصابة) ، فقد ينتج عن المرض.
  • يمكن أن يؤدي اضطراب الفلورا المهبلية إلى التهاب المهبل الجرثومي.

الشروط الاساسية

  • التهاب المسالك البولية: العثور على البكتيريا أو الكائنات الحية الدقيقة الأخرى ، مثل الخمائر ، في بول المثانة مع أو بدون أعراض سريرية ومع أو بدون مرض كلوي.

الميكروبيوم البولي التناسلي

الميكروبيوم البشري ، أو الكائنات الحية الدقيقة البشرية ، هو مجموع الكائنات الحية الدقيقة الموجودة على السطح والطبقات العميقة من الجلد ، في اللعاب والغشاء المخاطي للفم ، في الملتحمة ، وفي الجهاز الهضمي. وهي تشمل البكتيريا والفطريات والعتائق. تؤدي بعض هذه الكائنات مهامًا مفيدة للعائل البشري. ومع ذلك ، فإن الغالبية ليس لها تأثير مفيد أو ضار معروف. تلك التي يُتوقع وجودها والتي في الظروف العادية لا تسبب المرض ، ولكنها تشارك بدلاً من ذلك في الحفاظ على الصحة ، تعتبر أعضاء في النباتات الطبيعية.

تعيش الميكروبات في الجلد والغشاء المخاطي. ويشكل دورهم جزءًا من فسيولوجيا الإنسان الطبيعية والصحية ؛ ومع ذلك ، إذا زادت أعداد الميكروبات عن نطاقاتها النموذجية (غالبًا بسبب ضعف الجهاز المناعي) أو إذا كانت الميكروبات تسكن مناطق غير نمطية من الجسم (مثل سوء النظافة أو الإصابة) ، فقد ينتج عن المرض.

نسب الميكروبات

تشير التقديرات إلى أن 500 إلى 1000 نوع من البكتيريا تعيش في أمعاء الإنسان وعدد مماثل تقريبًا على الجلد. الخلايا البكتيرية أصغر بكثير من الخلايا البشرية ، وهناك ما لا يقل عن عشرة أضعاف عدد البكتيريا الموجودة في الخلايا البشرية في الجسم (حوالي 1014 مقابل 1013). يمكن أن تعمل بكتيريا الفلورا الطبيعية كمسببات الأمراض الانتهازية في أوقات انخفاض المناعة. تتكون البكتيريا المهبلية في الغالب من أنواع مختلفة من العصيات اللبنية. كان يُعتقد منذ فترة طويلة أن أكثر هذه الأنواع شيوعًا هو Lactobacillus acidophilus ، ولكن تبين لاحقًا أن النوع الأكثر شيوعًا هو L. iners يليه L. crispatus. توجد بكتيريا Lactobacilli أخرى في المهبل هي L. jensenii و L. delbruekii و L. gasseri. يمكن أن يؤدي اضطراب الفلورا المهبلية إلى التهاب المهبل الجرثومي.


فلورا المهبل

كاشف ج. بيراتشا هو طبيب معتمد من مجلس الإدارة ولديه أكثر من 14 عامًا من الخبرة في علاج المرضى في مستشفيات الرعاية الحادة ومرافق إعادة التأهيل.

الفلورا المهبلية هي البكتيريا التي تعيش داخل المهبل. تهيمن أنواع مختلفة من العصيات اللبنية على النباتات المهبلية الطبيعية.

تساعد العصيات اللبنية في الحفاظ على صحة المهبل عن طريق إنتاج حمض اللاكتيك ، وبيروكسيد الهيدروجين ، والمواد الأخرى التي تمنع نمو الخميرة وغيرها من الكائنات الحية غير المرغوب فيها. أنها تحافظ على المهبل عند درجة حموضة صحية حوالي 4.

تساعد هذه البيئة الحمضية المعتدلة على الحماية من العدوى. وكذلك المواد الأخرى التي ينتجونها. هذه البكتيريا هي جزء مهم من النظام البيئي المهبلي الصحي.


محتويات

على الرغم من أنه معروف على نطاق واسع باسم فلورا أو الميكروفلورا، هذه تسمية خاطئة من الناحية الفنية ، منذ جذر الكلمة النباتية يتعلق بالنباتات ، و الكائنات الحية يشير إلى المجموعة الكاملة من الكائنات الحية في نظام بيئي معين. في الآونة الأخيرة ، المصطلح الأنسب ميكروبيوتا يتم تطبيقه ، على الرغم من أن استخدامه لم يتغلب على الاستخدام الراسخ والاعتراف به النباتية فيما يتعلق بالبكتيريا والكائنات الحية الدقيقة الأخرى. كلا المصطلحين يستخدمان في أدبيات مختلفة. [4]

اعتبارًا من عام 2014 ، تم الإبلاغ في كثير من الأحيان في وسائل الإعلام الشعبية وفي الأدبيات العلمية عن وجود حوالي 10 أضعاف عدد الخلايا الميكروبية في جسم الإنسان مثل الخلايا البشرية ، واستند هذا الرقم إلى تقديرات أن الميكروبيوم البشري يحتوي على حوالي 100 تريليون بكتيري. الخلايا وأن الإنسان البالغ لديه عادة حوالي 10 تريليون خلية بشرية. [8] في عام 2014 ، نشرت الأكاديمية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة أسئلة وأجوبة شددت على أن عدد الخلايا الميكروبية وعدد الخلايا البشرية كلاهما تقديرات ، ولاحظت أن الأبحاث الحديثة قد توصلت إلى تقدير جديد لعدد الخلايا البشرية - ما يقرب من 37.2 تريليون خلية ، مما يعني أن نسبة الخلايا الميكروبية إلى البشرية ، إذا كان التقدير الأصلي لـ 100 تريليون خلية بكتيرية صحيحًا ، هو أقرب إلى 3: 1. [8] [9] في عام 2016 ، نشرت مجموعة أخرى تقديرًا جديدًا للنسبة تقريبيًا 1: 1 (1.3: 1 ، مع "عدم يقين بنسبة 25 ٪ وتباين بنسبة 53 ٪ عن تعداد الذكور المعياريين الذين يبلغ وزنهم 70 كجم "). [10] [3]

التقدير الأحدث هو نسبة 1.3 خلية بكتيرية لكل خلية بشرية واحدة في حين أن عدد العاثيات والفيروسات يفوق عدد الخلايا البكتيرية بترتيب من حيث الحجم على الأقل. يقدر عدد الجينات البكتيرية (بافتراض وجود 1000 نوع بكتيري في الأمعاء مع 2000 جين لكل نوع) بـ 2،000،000 جين ، أي 100 ضعف عدد ما يقرب من 20،000 جين بشري. [11]

تكمن مشكلة توضيح الميكروبيوم البشري في تحديد أعضاء المجتمع الميكروبي الذي يشمل البكتيريا وحقيقيات النوى والفيروسات. [12] يتم ذلك في المقام الأول باستخدام الدراسات القائمة على الحمض النووي ، على الرغم من إجراء الدراسات القائمة على الحمض النووي الريبي والبروتين والمستقلب. [12] [13] عادة ما يمكن تصنيف دراسات الميكروبيوم المعتمدة على الحمض النووي على أنها إما دراسات أمبليكون مستهدفة أو دراسات ميتاجينوميه بندقية حديثة. يركز الأول على جينات محددة معروفة وهو مفيد في المقام الأول من الناحية التصنيفية ، في حين أن الأخير هو نهج ميتاجينومي كامل يمكن استخدامه أيضًا لدراسة الإمكانات الوظيفية للمجتمع. [12] أحد التحديات الموجودة في دراسات الميكروبيوم البشري ، ولكن ليس في الدراسات الميتاجينومية الأخرى ، هو تجنب تضمين الحمض النووي للمضيف في الدراسة. [14]

بصرف النظر عن مجرد توضيح تكوين الميكروبيوم البشري ، فإن أحد الأسئلة الرئيسية المتعلقة بالميكروبيوم البشري هو ما إذا كان هناك "جوهر" ، أي ما إذا كانت هناك مجموعة فرعية من المجتمع يتم مشاركتها بين معظم البشر. [15] [16] إذا كان هناك نواة ، فسيكون من الممكن ربط بعض التراكيب المجتمعية بحالات المرض ، وهو أحد أهداف مشروع الميكروبيوم البشري. من المعروف أن الميكروبيوم البشري (مثل ميكروبيوتا الأمعاء) متغير بدرجة كبيرة سواء داخل موضوع واحد أو بين أفراد مختلفين ، وهي ظاهرة تُلاحظ أيضًا في الفئران. [4]

في 13 يونيو 2012 ، أعلن مدير المعاهد الوطنية للصحة فرانسيس كولينز عن معلم رئيسي لمشروع الميكروبيوم البشري (HMP). [7] وكان الإعلان مصحوبًا بسلسلة من المقالات المنسقة التي نُشرت في مجلة Nature [17] [18] والعديد من المجلات في المكتبة العامة للعلوم (PLoS) في نفس اليوم. من خلال رسم خرائط التركيب الميكروبي الطبيعي للبشر الأصحاء باستخدام تقنيات تسلسل الجينوم ، أنشأ باحثو HMP قاعدة بيانات مرجعية وحدود التباين الجرثومي الطبيعي لدى البشر. من 242 متطوعًا أمريكيًا يتمتعون بصحة جيدة ، تم جمع أكثر من 5000 عينة من أنسجة من 15 (رجالًا) إلى 18 (نساء) موقعًا للجسم مثل الفم والأنف والجلد والأمعاء السفلية (البراز) والمهبل. تم تحليل جميع الحمض النووي ، البشري والميكروبي ، باستخدام آلات تسلسل الحمض النووي. تم استخراج بيانات الجينوم الميكروبي عن طريق تحديد الحمض النووي الريبي الريبوسومي النوعي البكتيري ، 16S rRNA. حسب الباحثون أن أكثر من 10000 نوع ميكروبي تحتل النظام البيئي البشري وقد حددوا 81-99٪ من الأجناس.

تعديل تسلسل البندقية

غالبًا ما يكون من الصعب استزراع البكتيريا والعتيقات والفيروسات في المجتمعات المختبرية ، وبالتالي يمكن استغلال تقنيات التسلسل في علم الميتاجينوميات أيضًا. في الواقع ، توفر المعرفة الكاملة بوظائف وتوصيف سلالات ميكروبية معينة إمكانية كبيرة في الاكتشاف العلاجي وصحة الإنسان. [19]

جمع العينات وتحرير استخراج الحمض النووي

النقطة الرئيسية هي جمع كمية من الكتلة الحيوية الميكروبية كافية لأداء التسلسل وتقليل تلوث العينة لهذا السبب ، يمكن استخدام تقنيات التخصيب. على وجه الخصوص ، يجب أن تكون طريقة استخراج الحمض النووي جيدة لكل سلالة بكتيرية ، وليس للحصول على جينومات السلالات التي يسهل تحليلها. عادةً ما يُفضل التحلل الميكانيكي بدلاً من التحلل الكيميائي ، وقد يؤدي ضرب الخرزة إلى فقد الحمض النووي عند تحضير المكتبة. [19]

اعداد المكتبة وتحرير التسلسل

أكثر المنصات استخدامًا هي Illumina و Ion Torrent و Oxford Nanopore MinION و Pacific Bioscience Sequel ، على الرغم من أن منصة Illumina تعتبر الخيار الأكثر جاذبية نظرًا لتوفرها الواسع والإنتاجية العالية والدقة. لا توجد مؤشرات بخصوص الكمية الصحيحة للعينة المراد استخدامها. [19]

تحرير التجمع الميتاجينوم

ومع ذلك ، يتم استغلال نهج de novo ، فإنه يطرح بعض الصعوبات التي يجب التغلب عليها. تعتمد التغطية على وفرة كل جينوم في الجينومات منخفضة الوفرة في مجتمعها المحدد وقد تخضع للتجزئة إذا كان عمق التسلسل غير كافٍ لتجنب تكوين الفجوات. لحسن الحظ ، هناك مجمعات خاصة بالميتاجينوم للمساعدة ، لأنه في حالة وجود مئات السلالات ، يجب زيادة عمق التسلسل إلى أقصى حد. [19]

تحرير binning

لا يُعرف أي جينوم يُشتق منه كل كونتيج ، ولا عدد الجينومات الموجودة في العينة بداهة الهدف من هذه الخطوة هو تقسيم contigs إلى أنواع. يمكن أن تكون طرق إجراء مثل هذا التحليل إما تحت الإشراف (قاعدة بيانات ذات تسلسلات معروفة) أو غير خاضعة للإشراف (البحث المباشر عن مجموعات متصلة في البيانات المجمعة). ومع ذلك ، تتطلب كلتا الطريقتين نوعًا من المقياس لتحديد درجة التشابه بين كونتيج معين والمجموعة التي يجب وضعها فيها ، والخوارزميات لتحويل أوجه التشابه إلى تخصيصات في المجموعات. [19]

التحليل بعد المعالجة تحرير

يعد التحليل الإحصائي ضروريًا للتحقق من صحة النتائج التي تم الحصول عليها (يمكن استخدام ANOVA لتحديد حجم الاختلافات بين المجموعات) إذا تم إقرانها بأدوات رسومية ، يمكن تصور النتيجة وفهمها بسهولة. [19]

بمجرد تجميع الميتاجينوم ، من الممكن استنتاج الإمكانات الوظيفية للميكروبيوم. التحديات الحسابية لهذا النوع من التحليل أكبر من تلك التي تواجه الجينوم الفردي ، لأن مجمعات metagenomes عادة ما تكون ذات جودة رديئة ، والعديد من الجينات المستعادة غير كاملة أو مجزأة. بعد خطوة تحديد الجين ، يمكن استخدام البيانات لإجراء تعليق توضيحي وظيفي عن طريق المحاذاة المتعددة للجينات المستهدفة مقابل قواعد بيانات أخصائيي تقويم العظام. [20]

علامة التحليل الجيني تحرير

إنها تقنية تستغل البادئات لاستهداف منطقة وراثية معينة وتمكن من تحديد السلالات الجرثومية. تتميز المنطقة الجينية بمنطقة شديدة التباين والتي يمكن أن تمنح تحديدًا تفصيليًا ، يتم تحديدها بواسطة المناطق المحفوظة ، والتي تعمل كمواقع ربط للبادئات المستخدمة في تفاعل البوليميراز المتسلسل. الجين الرئيسي المستخدم لوصف البكتيريا والعتائق هو جين 16S rRNA ، بينما يعتمد تحديد الفطريات على فاصل النسخ الداخلي (ITS). هذه التقنية سريعة وليست باهظة الثمن وتمكن من الحصول على تصنيف منخفض الدقة لعينة ميكروبية ، وهي مثالية للعينات التي قد تكون ملوثة بالحمض النووي المضيف. يختلف تقارب التمهيدي بين جميع متواليات الحمض النووي ، مما قد يؤدي إلى تحيزات أثناء تفاعل التضخيم ، في الواقع ، تكون العينات منخفضة الوفرة عرضة لأخطاء التضخيم ، نظرًا لأن الكائنات الدقيقة الملوثة الأخرى تؤدي إلى زيادة التمثيل في حالة زيادة دورات PCR. لذلك ، يمكن أن يساعد تحسين اختيار التمهيدي في تقليل هذه الأخطاء ، على الرغم من أنه يتطلب معرفة كاملة بالكائنات الحية الدقيقة الموجودة في العينة ، ووفرة النسبية لها. [21]

يمكن أن يتأثر التحليل الجيني للعلامة باختيار التمهيدي في هذا النوع من التحليل ، فمن المستحسن استخدام بروتوكول تم التحقق من صحته جيدًا (مثل ذلك المستخدم في مشروع Earth Microbiome). أول شيء يجب القيام به في تحليل amplicon الجيني للعلامة هو إزالة أخطاء التسلسل ، حيث أن الكثير من منصات التسلسل موثوقة للغاية ، ولكن معظم تنوع التسلسل الظاهر لا يزال بسبب أخطاء أثناء عملية التسلسل. لتقليل هذه الظاهرة ، تتمثل الطريقة الأولى في تجميع التسلسلات العنقودية في وحدة التصنيف التشغيلية (OTUs): تدمج هذه العملية التسلسلات المتشابهة (عادةً ما يتم اعتماد عتبة تشابه بنسبة 97 ٪) في ميزة واحدة يمكن استخدامها في خطوات التحليل الإضافية ، ولكن هذه الطريقة قد تجاهل SNPs لأنها ستتجمع في وحدة OTU واحدة. نهج آخر هو Oligotyping ، والذي يتضمن معلومات خاصة بالموقع من تسلسل الرنا الريباسي 16 ثانية لاكتشاف الاختلافات الصغيرة للنيوكليوتيدات ومن التمييز بين الأصناف المتميزة وثيقة الصلة. تعطي هذه الطرق كناتج جدولًا لتسلسلات الحمض النووي وأعداد التسلسلات المختلفة لكل عينة بدلاً من OTU. [21]

خطوة أخرى مهمة في التحليل هي تعيين اسم تصنيفي للتسلسلات الميكروبية في البيانات. يمكن القيام بذلك باستخدام مناهج التعلم الآلي التي يمكن أن تصل إلى دقة على مستوى الجنس تبلغ حوالي 80٪. توفر حزم التحليل الشائعة الأخرى دعمًا للتصنيف التصنيفي باستخدام المطابقات التامة لقواعد البيانات المرجعية ويجب أن توفر قدرًا أكبر من التحديد ، ولكن الحساسية الضعيفة. يجب إجراء مزيد من الفحص للكائنات الحية الدقيقة غير المصنفة بحثًا عن تسلسل العضية. [21]

تحرير تحليل النشوء والتطور

تستخدم العديد من الطرق التي تستغل الاستدلال الوراثي جين 16SRNA لـ Archea والبكتيريا وجين 18SRNA لحقيقيات النوى. تعتمد طرق المقارنة الوراثية (PCS) على مقارنة سمات متعددة بين الكائنات الحية الدقيقة ، والمبدأ هو: كلما كانت مرتبطة ارتباطًا وثيقًا ، زاد عدد السمات التي تشترك فيها. عادةً ما تقترن أجهزة الكمبيوتر الشخصية بالمربعات الصغرى المعممة للتطور الوراثي (PGLS) أو غيرها من التحليلات الإحصائية للحصول على نتائج أكثر أهمية. تُستخدم إعادة بناء حالة الأسلاف في دراسات الميكروبيوم لإسناد قيم السمات للأصناف التي تكون سماتها غير معروفة. يتم إجراء هذا بشكل شائع باستخدام PICRUSt ، والذي يعتمد على قواعد البيانات المتاحة. يتم اختيار المتغيرات التطورية من قبل الباحثين وفقًا لنوع الدراسة: من خلال اختيار بعض المتغيرات ذات المعلومات البيولوجية المهمة ، من الممكن تقليل أبعاد البيانات المراد تحليلها. [22]

عادةً ما يتم إجراء مسافة المعرفة بالتطور الوراثي باستخدام UniFrac أو أدوات مماثلة ، مثل مؤشر Soresen أو Rao's D ، لتحديد الاختلافات بين المجتمعات المختلفة. تتأثر كل هذه الطرق سلبًا بنقل الجينات الأفقي (HGT) ، حيث يمكن أن تولد أخطاء وتؤدي إلى ارتباط الأنواع البعيدة. هناك طرق مختلفة لتقليل التأثير السلبي لـ HGT: استخدام جينات متعددة أو أدوات حسابية لتقييم احتمالية أحداث HGT المفترضة. [22]

تحرير البكتيريا

تعيش الميكروبات (مثل البكتيريا والخمائر) في الجلد والأسطح المخاطية في أجزاء مختلفة من الجسم. يشكل دورها جزءًا من فسيولوجيا الإنسان الطبيعية والصحية ، ولكن إذا زادت أعداد الميكروبات عن نطاقاتها النموذجية (غالبًا بسبب ضعف جهاز المناعة) أو إذا كانت الميكروبات تتكاثر (مثل سوء النظافة أو الإصابة) في مناطق الجسم غير المستعمرة عادةً أو عقيم (مثل الدم ، أو الجهاز التنفسي السفلي ، أو تجويف البطن) ، يمكن أن ينتج عن المرض (يسبب ، على التوالي ، تجرثم الدم / تعفن الدم ، والالتهاب الرئوي ، والتهاب الصفاق). [ هناك حاجة إلى الاقتباس الطبي ]

وجد مشروع Human Microbiome أن الأفراد يستضيفون آلاف الأنواع البكتيرية ، ومواقع مختلفة من الجسم لها مجتمعاتهم المميزة. أظهرت مواقع الجلد والمهبل تنوعًا أصغر من الفم والأمعاء ، وهي تظهر ثراء أكبر. يختلف التركيب البكتيري لموقع معين على الجسم من شخص لآخر ، ليس فقط من حيث النوع ، ولكن أيضًا بكثرة. البكتيريا من نفس النوع الموجودة في جميع أنحاء الفم من أنواع فرعية متعددة ، مفضلة أن تسكن مواقع مختلفة بشكل واضح في الفم. حتى الأنماط المعوية في الأمعاء البشرية ، والتي كان يُعتقد سابقًا أنها مفهومة جيدًا ، هي من طيف واسع من المجتمعات ذات حدود تصنيفية غير واضحة. [23] [24]

تشير التقديرات إلى أن ما بين 500 إلى 1000 نوع من البكتيريا تعيش في أمعاء الإنسان ولكنها تنتمي إلى عدد قليل من الشُّعَب: تهيمن العناصر الثابتة والجراثيم ولكن هناك أيضًا بكتيريا بروتيوبكتريا وفيروكوميكروبيا وأكتينوبكتيريا وفوسوباكتيريا وسيانوبكتيريا. [25]

وهناك عدد من أنواع البكتيريا مثل الشعيات اللزجة و أ، تعيش في الفم ، حيث تكون جزءًا من مادة لزجة تسمى البلاك. إذا لم يتم إزالتها عن طريق الفرشاة ، فإنها تتصلب في التفاضل والتكامل (وتسمى أيضًا الجير). تفرز البكتيريا نفسها أيضًا الأحماض التي تذوب مينا الأسنان ، مما يتسبب في تسوس الأسنان.

تتكون البكتيريا المهبلية في الغالب من أنواع مختلفة من العصيات اللبنية. كان يعتقد منذ فترة طويلة أن أكثر هذه الأنواع شيوعًا هو الملبنة الحمضة، ولكن تبين لاحقًا أن L. iners هو في الواقع الأكثر شيوعًا ، يليه كريسباتوس. توجد العصيات اللبنية الأخرى الموجودة في المهبل L. jensenii، L. delbruekii و L. gasseri. يمكن أن يؤدي اضطراب الفلورا المهبلية إلى عدوى مثل التهاب المهبل الجرثومي أو داء المبيضات ("عدوى الخميرة").

تحرير العتائق

توجد العتائق في الأمعاء البشرية ، ولكن على عكس التنوع الهائل للبكتيريا في هذا العضو ، فإن أعداد الأنواع البدائية محدودة للغاية. [26] المجموعة المهيمنة هي الميثانوجينات على وجه الخصوص ميثانوبريفيباكتر سميثي و Methanosphaera stadtmanae. [27] ومع ذلك ، فإن الاستعمار بواسطة الميثانوجينات متغير ، وحوالي 50٪ فقط من البشر لديهم مجموعات يسهل اكتشافها من هذه الكائنات. [28]

اعتبارًا من عام 2007 ، لم يتم التعرف على أمثلة واضحة لمسببات الأمراض البدائية ، [29] [30] على الرغم من اقتراح وجود علاقة بين وجود بعض الميثانوجينات وأمراض اللثة البشرية. [31]

تحرير الفطريات

الفطريات ، ولا سيما الخميرة ، موجودة في أمعاء الإنسان. [32] [33] [34] [35] أفضل هذه الدراسات هي الكانديدا بسبب قدرتها على أن تصبح مسببة للأمراض في نقص المناعة وحتى في المضيفين الأصحاء. [33] [34] [35] توجد الخميرة أيضًا على الجلد ، [32] مثل ملاسيزية الأنواع ، حيث تستهلك الزيوت التي تفرز من الغدد الدهنية. [36] [37]

تحرير الفيروسات

تستعمر الفيروسات ، وخاصة الفيروسات البكتيرية (العاثيات) ، مواقع الجسم المختلفة. تشمل هذه المواقع المستعمرة الجلد ، [38] الأمعاء ، [39] الرئتين ، [40] وتجويف الفم. [41] ارتبطت مجتمعات الفيروسات ببعض الأمراض ، وهي لا تعكس ببساطة المجتمعات البكتيرية. [42] [43] [44]

تحرير الجلد

وجدت دراسة أجريت على 20 موقعًا جلديًا على كل من عشرة أشخاص أصحاء ، 205 أجناسًا محددة في 19 شعبة بكتيرية ، مع تحديد معظم التسلسلات لأربعة شُعَب: البكتيريا الشعاعية (51.8٪) ، الثبات (24.4٪) ، البروتيوباكتيريا (16.5٪) ، والبكتيريا ( 6.3٪). [٤٥] يوجد عدد كبير من الأجناس الفطرية على جلد الإنسان السليم ، مع بعض التباين حسب منطقة الجسم ، ومع ذلك ، أثناء الحالات المرضية ، تميل بعض الأجناس إلى السيطرة في المنطقة المصابة. [32] على سبيل المثال ، ملاسيزية هو المهيمن في التهاب الجلد التأتبي و أكريمونيوم هو المسيطر على فروة الرأس المصابة بقشرة الرأس. [32]

يعمل الجلد كحاجز لردع غزو الميكروبات المسببة للأمراض. يحتوي جلد الإنسان على ميكروبات تعيش إما في الجلد أو عليه ويمكن أن تكون داخلية أو عابرة. تختلف أنواع الكائنات الحية الدقيقة المقيمة فيما يتعلق بنوع الجلد على جسم الإنسان. توجد غالبية الميكروبات على الخلايا السطحية على الجلد أو تفضل الارتباط بالغدد. هذه الغدد مثل الغدد الدهنية أو العرقية تزود الميكروبات بالماء والأحماض الأمينية والأحماض الدهنية. بالإضافة إلى ذلك ، غالبًا ما تكون البكتيريا المقيمة المرتبطة بالغدد الدهنية إيجابية الجرام ويمكن أن تكون مسببة للأمراض. [2]

تحرير الملتحمة

عادة ما يوجد عدد قليل من البكتيريا والفطريات في الملتحمة. [32] [46] تشتمل فئات البكتيريا على مكورات موجبة الجرام (على سبيل المثال ، المكورات العنقودية والمكورات العقدية) والقضبان سالبة الجرام والمكورات (على سبيل المثال ، المستدمية و النيسرية) حاضرون. [46] تشمل الأجناس الفطرية الكانديدا, فطر الرشاشيات، و بنسيليوم. [32] تفرز الغدد الدمعية باستمرار ، مما يحافظ على رطوبة الملتحمة ، بينما يؤدي الوميض المتقطع إلى تزييت الملتحمة ويزيل المواد الغريبة. تحتوي الدموع على مبيدات الجراثيم مثل الليزوزيم ، بحيث تواجه الكائنات الدقيقة صعوبة في البقاء على قيد الحياة من الليزوزيم والاستقرار على الأسطح الظهارية.

تحرير الجهاز الهضمي

في البشر ، يتم تحديد تكوين ميكروبيوم الجهاز الهضمي أثناء الولادة. [51] تؤثر الولادة القيصرية أو الولادة المهبلية أيضًا على التركيب الميكروبي للأمعاء. الأطفال الذين يولدون من خلال القناة المهبلية لديهم ميكروبات أمعاء مفيدة غير مسببة للأمراض مماثلة لتلك الموجودة في الأم. [52] ومع ذلك ، فإن الميكروبات المعوية للأطفال الذين يولدون عن طريق القسم C تأوي المزيد من البكتيريا المسببة للأمراض مثل Escherichia coli و Staphylococcus وتستغرق وقتًا أطول لتطوير مجهريات الأمعاء المفيدة غير المسببة للأمراض. [53]

العلاقة بين بعض النباتات المعوية والبشر ليست مجرد علاقة تعايشية (تعايش غير ضار) ، بل علاقة متبادلة. [2] تفيد بعض الكائنات الحية الدقيقة في الأمعاء البشرية المضيف عن طريق تخمير الألياف الغذائية إلى أحماض دهنية قصيرة السلسلة (SCFAs) ، مثل حمض الأسيتيك وحمض الزبد ، والتي يمتصها المضيف بعد ذلك. [4] [54] تلعب البكتيريا المعوية أيضًا دورًا في تصنيع فيتامين ب وفيتامين ك بالإضافة إلى استقلاب الأحماض الصفراوية والستيرولات والمواد الغريبة الحيوية. [2] [54] الأهمية النظامية لـ SCFAs والمركبات الأخرى التي تنتجها تشبه الهرمونات ويبدو أن فلورا الأمعاء نفسها تعمل كعضو من أعضاء الغدد الصماء ، [54] وقد ارتبط عدم انتظام فلورا الأمعاء بمجموعة من الالتهابات وظروف المناعة الذاتية. [4] [55]

يتغير تكوين فلورا الأمعاء البشرية بمرور الوقت ، عندما يتغير النظام الغذائي ، ومع تغيرات الصحة العامة. [4] [55] وجدت مراجعة منهجية لـ 15 تجربة بشرية عشوائية محكومة من يوليو 2016 أن بعض السلالات المتاحة تجاريًا من بكتيريا بروبيوتيك من Bifidobacterium و اكتوباكيللوس أجناس (ب. لونغوم, بريف, ب. الرضع, L. helveticus, L. rhamnosus, L. الأخمصية، و L. كازي) ، عندما تؤخذ عن طريق الفم بجرعات يومية من 10 9-10 10 وحدات تشكيل مستعمرة (CFU) لمدة 1-2 شهر ، تمتلك فعالية علاجية (أي تحسن النتائج السلوكية) في بعض اضطرابات الجهاز العصبي المركزي - بما في ذلك القلق والاكتئاب والتوحد اضطراب الطيف والوسواس القهري - ويحسن جوانب معينة من الذاكرة. [56] ومع ذلك ، فقد وجد أيضًا أن التغيرات في تكوين الكائنات الحية الدقيقة في الأمعاء مرتبطة بالتأثيرات الضارة على الصحة. في مقال نشره موسو وآخرون ، وجد أن ميكروبيوتا الأمعاء لدى الأفراد الذين يعانون من السمنة المفرطة تحتوي على مواد أكثر ثباتًا وأقل من البكتيريا من الأفراد الأصحاء. [57] يُعتقد أن هذا التغيير في نسبة الميكروبات قد يساهم في زيادة البكتيريا بشكل أكثر كفاءة في استخلاص الطاقة من الطعام. استخدم الباحثون تسلسل البندقية لمقارنة ميكروبيوتا الفئران البدينة بالفئران الخالية من الدهون. ووجدوا أن جينومات الفئران البدينة تتكون من وفرة من الجينات المشفرة للإنزيمات القادرة على تكسير السكريات التي لا يهضمها جسم الإنسان وحده. [58]

علاوة على ذلك ، أكدت دراسة أجراها جوردون وزملاؤه أن تكوين الميكروبات هو الذي يسبب السمنة وليس العكس. وقد تم ذلك عن طريق زرع ميكروبات الأمعاء من الفئران البدينة التي يسببها النظام الغذائي (DIO) أو الفئران الخالية من الدهون في الفئران الخالية من الجراثيم الخالية من الجراثيم والتي لا تحتوي على ميكروبيوم. ووجدوا أن الفئران المزروعة بميكروبات أمعاء الفئران DIO تحتوي على دهون كلية أعلى بكثير من الفئران المزروعة بميكروبات الفئران الخالية من الدهون عندما تتغذى على نفس النظام الغذائي. [59]

دراسة منفصلة ، أكملها Ridaura وآخرون. في عام 2013 ، تم إجراء أول عملية زرع براز بشري في فئران خالية من الجراثيم. نشأ البراز البشري الذي تم جمعه من توائم إناث بالغة مع نسب دهون مختلفة بشكل ملحوظ في الجسم. تمكن الباحثون بشكل أساسي من نقل النمط الظاهري للسمنة والنمط الظاهري النحيف إلى الفئران ، بينما كان كلاهما يتغذى على الفئران قليلة الدسم. وزادت الفئران المصابة بالبراز المستمدة من التوأم البدين من كتلة الجسم والدهون الكلية ، في حين أن الفئران المصابة ببراز مشتق من التوأم الأقل رشاقة لم تظهر عليها سمات أو أعراض شبيهة بالسمنة. [60]

تحرير مجرى البول والمثانة

يبدو أن الجهاز البولي التناسلي يحتوي على ميكروبيوتا ، [61] [62] وهو اكتشاف غير متوقع في ضوء الاستخدام طويل الأمد لطرق الزراعة الميكروبيولوجية السريرية القياسية للكشف عن البكتيريا في البول عندما يظهر الناس علامات عدوى في المسالك البولية. من الشائع أن تظهر هذه الاختبارات عدم وجود بكتيريا. [63] يبدو أن طرق الاستنبات الشائعة لا تكتشف أنواعًا كثيرة من البكتيريا والكائنات الحية الدقيقة الأخرى الموجودة بشكل طبيعي. [63] اعتبارًا من عام 2017 ، تم استخدام طرق التسلسل لتحديد هذه الكائنات الدقيقة لتحديد ما إذا كانت هناك اختلافات في الكائنات الحية الدقيقة بين الأشخاص الذين يعانون من مشاكل في المسالك البولية والذين يتمتعون بصحة جيدة. [61] [62] لتقييم ميكروبيوم المثانة بشكل صحيح على عكس الجهاز البولي التناسلي ، يجب جمع عينة البول مباشرة من المثانة ، والذي يتم غالبًا باستخدام قسطرة. [64]

تحرير المهبل

تشير الجراثيم المهبلية إلى تلك الأنواع والأجناس التي تستعمر المهبل. تلعب هذه الكائنات دورًا مهمًا في الحماية من العدوى والحفاظ على صحة المهبل. [65] الكائنات الدقيقة المهبلية الأكثر وفرة في النساء قبل انقطاع الطمث هي من الجنس اكتوباكيللوس، الذي يقمع مسببات الأمراض عن طريق إنتاج بيروكسيد الهيدروجين وحمض اللاكتيك. [34] [65] [66] يختلف تكوين الأنواع البكتيرية ونسبها تبعًا لمرحلة الدورة الشهرية. [67] [68] [ يحتاج التحديث ] يؤثر العرق أيضًا على الفلورا المهبلية. يكون حدوث العصيات اللبنية المنتجة لبيروكسيد الهيدروجين أقل عند النساء الأميركيات من أصول إفريقية ويكون الرقم الهيدروجيني المهبلي أعلى. [69] تم ربط العوامل المؤثرة الأخرى مثل الاتصال الجنسي والمضادات الحيوية بفقدان العصيات اللبنية. [66] علاوة على ذلك ، فقد وجدت الدراسات أن الجماع باستخدام الواقي الذكري يبدو أنه يغير مستويات العصيات اللبنية ، ويزيد من مستوى الإشريكية القولونية داخل الفلورا المهبلية. [66] التغيرات في الجراثيم المهبلية الطبيعية والصحية هي مؤشر على وجود عدوى ، [70] مثل داء المبيضات أو التهاب المهبل الجرثومي. [66] المبيضات البيض يمنع نمو اكتوباكيللوس الأنواع ، بينما اكتوباكيللوس الأنواع التي تنتج بيروكسيد الهيدروجين تمنع نمو وفوعة المبيضات البيض في كل من المهبل والأمعاء. [32] [34] [35]

تشمل الأجناس الفطرية التي تم اكتشافها في المهبل الكانديدا, بيتشيا, يوروتيوم, النوباء, رودوتورولا، و كلادوسبوريوم، من بين أمور أخرى. [32]

تحرير المشيمة

حتى وقت قريب ، كانت المشيمة تعتبر عضوًا معقمًا ، ولكن تم التعرف على الأنواع البكتيرية المتعايشة وغير المسببة للأمراض والأجناس الموجودة في أنسجة المشيمة. [71] [72] [73]

تحرير الرحم

حتى وقت قريب ، كان الجهاز التناسلي العلوي عند النساء يعتبر بيئة معقمة. تعيش مجموعة متنوعة من الكائنات الحية الدقيقة في رحم النساء اللائي لا تظهر عليهن أعراض في سن الإنجاب. يختلف ميكروبيوم الرحم اختلافًا كبيرًا عن الميكروبيوم في المهبل والجهاز الهضمي. [74]

تحرير تجويف الفم

تسمح البيئة الموجودة في فم الإنسان بنمو الكائنات الحية الدقيقة المميزة الموجودة هناك. يوفر مصدرًا للمياه والمغذيات ، فضلاً عن درجة حرارة معتدلة. [2] تلتصق الميكروبات المقيمة بالفم بالأسنان واللثة لمقاومة التدفق الميكانيكي من الفم إلى المعدة حيث يتم تدمير الميكروبات الحساسة للحمض بواسطة حمض الهيدروكلوريك. [2] [34]

تشمل البكتيريا اللاهوائية في تجويف الفم ما يلي: الشعيات, أراكنيا, باكتيرويدس, Bifidobacterium, يوبكتيريوم, المغزلية, اكتوباكيللوس, ليبتوتريشيا, المكورات العقدية, الببتوستربتوكوكس, Propionibacterium, سيلينوموناس, اللولبية، و فيلونيلا. [75] [ يحتاج التحديث ] أجناس الفطريات التي توجد بشكل متكرر في الفم تشمل الكانديدا, كلادوسبوريوم, فطر الرشاشيات, الفيوزاريوم, جلوموس, النوباء, بنسيليوم، و المستخفية، من بين أمور أخرى. [32]

تتراكم البكتيريا على كل من أنسجة الفم الصلبة واللينة في البيوفيلم مما يسمح لها بالالتصاق والسعي في بيئة الفم مع الحماية من العوامل البيئية والعوامل المضادة للميكروبات. [76] يلعب اللعاب دورًا رئيسيًا في استتباب البيوفيلم ، مما يسمح بإعادة استعمار البكتيريا لتشكيل والتحكم في النمو عن طريق فصل تراكم الأغشية الحيوية. [77] كما أنه يوفر وسيلة لتنظيم المواد الغذائية ودرجة الحرارة. يحدد موقع البيوفيلم نوع العناصر الغذائية المكشوفة التي يتلقاها. [78]

طورت البكتيريا الفموية آليات لاستشعار بيئتها والتهرب من العائل أو تعديله. ومع ذلك ، فإن نظام دفاع مضيف فطري عالي الكفاءة يراقب باستمرار الاستعمار البكتيري ويمنع الغزو البكتيري للأنسجة المحلية. يوجد توازن ديناميكي بين بكتيريا لوحة الأسنان ونظام الدفاع الفطري للمضيف. [79]

تلعب هذه الديناميكية بين تجويف الفم المضيف وميكروبات الفم دورًا رئيسيًا في الصحة والمرض لأنها توفر الدخول إلى الجسم. [80] يقدم التوازن الصحي علاقة تكافلية حيث تحد ميكروبات الفم من نمو مسببات الأمراض والالتزام بها بينما يوفر المضيف بيئة لها لتزدهر. [80] [76] التغيرات البيئية مثل تغير حالة المناعة وتحول الميكروبات المقيمة وتوافر المغذيات تتحول من علاقة متبادلة إلى علاقة طفيلية مما يؤدي إلى تعرض المضيف لأمراض الفم والجهازية. [76] ترتبط الأمراض الجهازية مثل مرض السكري وأمراض القلب والأوعية الدموية بسوء صحة الفم. [80] من الأهمية بمكان دور الكائنات الحية الدقيقة الفموية في مرضي الأسنان الرئيسيين: تسوس الأسنان وأمراض اللثة. [79] يتسبب استعمار العوامل الممرضة في اللثة في استجابة مناعية مفرطة مما يؤدي إلى وجود جيب حول الأسنان - وهو فراغ عميق بين السن واللثة. [76] هذا بمثابة خزان محمي غني بالدم مع العناصر الغذائية لمسببات الأمراض اللاهوائية. [76] يمكن أن ينتج المرض الجهازي في مواقع مختلفة من الجسم عن دخول ميكروبات الفم إلى الدم متجاوزة الجيوب اللثوية والأغشية الفموية. [80]

نظافة الفم السليمة المستمرة هي الطريقة الأساسية للوقاية من أمراض الفم والجهازية. [80] يقلل من كثافة الأغشية الحيوية وزيادة نمو البكتيريا المسببة للأمراض مما يؤدي إلى الإصابة بالمرض. [78] ومع ذلك ، فإن نظافة الفم السليمة قد لا تكون كافية لأن الميكروبيوم الفموي والجينات والتغيرات في الاستجابة المناعية تلعب دورًا في الإصابة بالعدوى المزمنة. [78] استخدام المضادات الحيوية يمكن أن يعالج العدوى المنتشرة بالفعل ولكنه غير فعال ضد البكتيريا داخل الأغشية الحيوية. [78]

تحرير الرئة

يشبه إلى حد كبير تجويف الفم ، يمتلك الجهاز التنفسي العلوي والسفلي وسائل ردع ميكانيكية لإزالة الميكروبات. تنتج الخلايا الكأسية مخاطًا يحبس الميكروبات ويخرجها من الجهاز التنفسي عن طريق تحريك الخلايا الظهارية الهدبية باستمرار. [2] بالإضافة إلى ذلك ، ينتج تأثير مبيد للجراثيم عن طريق مخاط الأنف الذي يحتوي على إنزيم الليزوزيم. [2] يبدو أن الجهاز التنفسي العلوي والسفلي يحتويان على مجموعته الخاصة من الجراثيم. [81] تنتمي الجراثيم البكتيرية الرئوية إلى 9 أجناس بكتيرية رئيسية: بريفوتيلا, سفينغوموناس, الزائفة, Acinetobacter, المغزلية, Megasphaera, فيلونيلا, المكورات العنقودية، و العقدية. يمكن لبعض البكتيريا التي تعتبر "حيويًا طبيعيًا" في الجهاز التنفسي أن تسبب مرضًا خطيرًا خاصةً في الأفراد الذين يعانون من نقص المناعة ، وتشمل هذه الأبراج العقدية, المستدمية النزلية, العقدية الرئوية, النيسرية السحائية، و المكورات العنقودية الذهبية. [ بحاجة لمصدر ] الأجناس الفطرية التي تتكون منها الفطريات الرئوية تشمل الكانديدا, ملاسيزية, نيوسارتوريا, السكريات، و فطر الرشاشيات، من بين أمور أخرى. [32]

لوحظ توزيع غير عادي للأجناس البكتيرية والفطرية في الجهاز التنفسي لدى الأشخاص المصابين بالتليف الكيسي. [32] [82] غالبًا ما تحتوي النباتات البكتيرية على بكتيريا مقاومة للمضادات الحيوية وبطيئة النمو ، ويتغير تواتر هذه العوامل الممرضة فيما يتعلق بالعمر. [82]

تحرير القناة الصفراوية

تقليديا ، اعتبرت القناة الصفراوية معقمة بشكل طبيعي ، ووجود الكائنات الحية الدقيقة في الصفراء هو علامة على العملية المرضية. تم تأكيد هذا الافتراض بالفشل في تخصيص السلالات البكتيرية من القناة الصفراوية الطبيعية. بدأت الأوراق في الظهور في عام 2013 تُظهر أن الكائنات الدقيقة الصفراوية الطبيعية هي طبقة وظيفية منفصلة تحمي القناة الصفراوية من استعمار الكائنات الحية الدقيقة الخارجية. [83]

تعتمد أجسام الإنسان على عدد لا يحصى من الجينات البكتيرية كمصدر للعناصر الغذائية الأساسية. [84] تشير كل من الدراسات الميتاجينومية والوبائية إلى الأدوار الحيوية للميكروبيوم البشري في الوقاية من مجموعة واسعة من الأمراض ، من مرض السكري من النوع 2 والسمنة إلى مرض التهاب الأمعاء ، ومرض باركنسون ، وحتى حالات الصحة العقلية مثل الاكتئاب. [85] العلاقة التكافلية بين ميكروبيوتا الأمعاء والبكتيريا المختلفة قد تؤثر على الاستجابة المناعية للفرد. [86] على الرغم من أن العلاج القائم على الميكروبيوم في مهده ، إلا أنه يبشر بالخير أيضًا ، وعلى الأخص في علاج مقاومة الأدوية جيم صعب العدوى [87] وفي علاج مرض السكري. [88]

المطثيات العسيرة عدوى تحرير

وجود ساحق للبكتيريا ، جيم صعب ، يؤدي إلى عدوى في الجهاز الهضمي ، ترتبط عادةً بخلل التنسج مع الجراثيم التي يُعتقد أنها ناجمة عن إعطاء المضادات الحيوية. يقضي استخدام المضادات الحيوية على بكتيريا الأمعاء المفيدة داخل الجهاز الهضمي ، والتي تمنع عادةً البكتيريا المسببة للأمراض من ترسيخ الهيمنة. [89] العلاج التقليدي ل جيم صعب تشمل العدوى نظامًا إضافيًا من المضادات الحيوية ، ومع ذلك ، فإن معدلات الفعالية تتراوح بين 20-30 ٪. [90] إدراكًا لأهمية بكتيريا الأمعاء الصحية ، لجأ الباحثون إلى إجراء يُعرف باسم زرع جراثيم البراز ، حيث يعاني المرضى من أمراض الجهاز الهضمي ، مثل جيم صعب العدوى ، تلقي محتوى براز من فرد سليم على أمل استعادة البكتيريا المعوية التي تعمل بشكل طبيعي. [91] زرع جراثيم البراز فعال بنسبة 85-90٪ تقريبًا في الأشخاص الذين يعانون من CDI الذين لم تنجح معهم المضادات الحيوية أو الذين يتكرر المرض لديهم بعد تناول المضادات الحيوية. [92] [93] يتعافى معظم الأشخاص الذين يعانون من CDI مع علاج FMT واحد. [94] [95] [96]

تحرير السرطان

على الرغم من أن السرطان بشكل عام مرض وراثي وعوامل بيئية ، فإن الكائنات الحية الدقيقة متورطة في حوالي 20 ٪ من السرطانات البشرية. [97] بشكل خاص للعوامل المحتملة في سرطان القولون ، كثافة البكتيريا أعلى بمليون مرة من الأمعاء الدقيقة ، ويحدث ما يقرب من 12 ضعفًا من السرطانات في القولون مقارنة بالأمعاء الدقيقة ، مما قد يؤدي إلى إنشاء دور ممرض للميكروبات في القولون وسرطانات المستقيم. [98] يمكن استخدام الكثافة الميكروبية كأداة تشخيصية في تقييم سرطانات القولون والمستقيم. [98]

قد تؤثر الجراثيم على التسرطن بثلاث طرق واسعة: (1) تغيير توازن تكاثر الخلايا السرطانية والموت ، (2) تنظيم وظيفة الجهاز المناعي ، و (3) التأثير على استقلاب العوامل والأطعمة والمستحضرات الصيدلانية التي ينتجها المضيف. [97] الأورام التي تظهر على الأسطح الحدودية ، مثل الجلد والبلعوم والجهاز التنفسي والجهاز الهضمي والجهاز البولي التناسلي ، تأوي الكائنات الحية الدقيقة. إن التواجد الجوهري للميكروبات في موقع الورم لا ينشئ ارتباطًا أو روابط سببية. بدلاً من ذلك ، قد تجد الميكروبات توتر أكسجين الورم أو ملف المغذيات داعمًا. قد يؤدي أيضًا انخفاض عدد الميكروبات المحددة أو الإجهاد التأكسدي إلى زيادة المخاطر. [97] [98] من بين حوالي 10 30 ميكروبًا على الأرض ، تم تصنيف عشرة من قبل الوكالة الدولية لأبحاث السرطان كمواد مسرطنة للبشر. [97] قد تفرز الميكروبات البروتينات أو العوامل الأخرى التي تؤدي مباشرة إلى تكاثر الخلايا في المضيف ، أو قد ترفع أو تخفض من تنظيم الجهاز المناعي للمضيف بما في ذلك دفع الالتهاب الحاد أو المزمن بطرق تساهم في التسرطن. [97]

فيما يتعلق بالعلاقة بين وظيفة المناعة وتطور الالتهاب ، فإن حواجز سطح الغشاء المخاطي معرضة للمخاطر البيئية ويجب إصلاحها بسرعة للحفاظ على التوازن. كما تقلل مرونة المضيف أو الكائنات الحية الدقيقة من مقاومة الأورام الخبيثة ، مما قد يؤدي إلى حدوث التهاب وسرطان. بمجرد اختراق الحواجز ، يمكن للميكروبات استنباط برامج تحريضية أو مثبطة للمناعة من خلال مسارات مختلفة. [97] على سبيل المثال ، يبدو أن الميكروبات المرتبطة بالسرطان تعمل على تنشيط إشارات NF-داخل الخلية الميكروية للورم. مستقبلات التعرف على الأنماط الأخرى ، مثل أفراد عائلة مستقبلات قليلة القلة المرتبطة بالنيوكليوتيدات (NLR) NOD-2, NLRP3, NLRP6 و NLRP12، قد تلعب دورًا في التوسط في سرطان القولون والمستقيم. [97] بالمثل هيليكوباكتر بيلوري يبدو أنه يزيد من خطر الإصابة بسرطان المعدة ، بسبب تحفيز الاستجابة الالتهابية المزمنة في المعدة. [97] [98]

مرض التهاب الأمعاء تحرير

يتكون مرض التهاب الأمعاء من مرضين مختلفين: التهاب القولون التقرحي ومرض كرون وكلاهما يصاحبه اضطرابات في ميكروبيوتا الأمعاء (المعروف أيضًا باسم دسباقتريوز).يظهر خلل التنسج هذا في شكل انخفاض التنوع الميكروبي في القناة الهضمية ، [99] [100] ويرتبط بعيوب في جينات المضيف التي تغير الاستجابة المناعية الفطرية لدى الأفراد. [99]

تحرير فيروس نقص المناعة البشرية

يؤثر تطور مرض فيروس العوز المناعي البشري على تكوين ووظيفة ميكروبيوتا الأمعاء ، مع وجود اختلافات ملحوظة بين السكان غير المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية ، والإيجابيين لفيروس نقص المناعة البشرية ، والمصابين بفيروس نقص المناعة البشرية بعد العلاج المضاد للفيروسات القهقرية. [ بحاجة لمصدر يقلل فيروس نقص المناعة البشرية من سلامة وظيفة الحاجز الظهاري للأمعاء من خلال التأثير على الوصلات الضيقة. يسمح هذا الانهيار بالانتقال عبر ظهارة الأمعاء ، والذي يُعتقد أنه يساهم في زيادة الالتهابات التي تظهر لدى الأشخاص المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية. [101]

تلعب الجراثيم المهبلية دورًا في إصابة فيروس نقص المناعة البشرية ، مع زيادة خطر العدوى والانتقال عندما تكون المرأة مصابة بالتهاب المهبل البكتيري ، وهي حالة تتميز بتوازن غير طبيعي للبكتيريا المهبلية. [102] يُلاحظ تحسن العدوى مع زيادة السيتوكينات المؤيدة للالتهابات وخلايا CCR5 + CD4 + في المهبل. ومع ذلك ، لوحظ انخفاض في العدوى مع زيادة مستويات المهبل اكتوباكيللوس ، مما يعزز حالة مضادة للالتهابات. [101]

تحرير الموت

مع الموت ، ينهار ميكروبيوم الجسم الحي وتسمى تركيبة مختلفة من الكائنات الحية الدقيقة necrobiome يثبت نفسه كمكون نشط مهم لعملية التحلل الفيزيائي المعقدة. يُعتقد أن التغييرات المتوقعة بمرور الوقت مفيدة للمساعدة في تحديد وقت الوفاة. [103] [104]

تساءلت الدراسات التي أجريت في عام 2009 عما إذا كان الانخفاض في الكائنات الحية (بما في ذلك الحيوانات الدقيقة) نتيجة للتدخل البشري قد يعيق صحة الإنسان ، وإجراءات سلامة المستشفيات ، وتصميم المنتجات الغذائية ، وعلاج الأمراض. [105]

تشير الأبحاث الأولية إلى أن التغييرات الفورية في الكائنات الحية الدقيقة قد تحدث عندما يهاجر شخص من بلد إلى آخر ، كما هو الحال عندما استقر المهاجرون التايلانديون في الولايات المتحدة [106] أو عندما هاجر الأمريكيون اللاتينيون إلى الولايات المتحدة. [107] كانت الخسائر في تنوع الكائنات الحية الدقيقة أكبر في الأفراد الذين يعانون من السمنة المفرطة وأطفال المهاجرين. [106] [107]


ملخص الدورة

  • اقترح ائتمان ECTS: 1.5 ECTS (يجب مناقشة هذا الأمر مع جامعتك المحلية)
  • مستوى: دورة دكتوراه أو ما بعد الدكتوراة
  • لغة: إنجليزي

الجراثيم هي مجتمعات ميكروبية متنوعة مرتبطة بالكائنات متعددة الخلايا. تركز معظم محاضرات الدورة على البشر كمضيف. يتم تقديم محاضرتين عن الجراثيم المرتبطة بالحيوانات والنباتات المستزرعة.

عدد الجينات الميكروبية المرتبطة بها يفوق عدد الجينات الموجودة في الكائن الحي المضيف. تؤثر مجتمعات الميكروبات وجينوماتها ، الميكروبيوم ، على العمليات الفسيولوجية للمضيف. يعد فهم كيفية تفاعل الكائنات الحية الدقيقة مع المضيف أمرًا بالغ الأهمية لفهم بيولوجيا المضيف وقابلية المضيف للأمراض المعدية والمزمنة والاستجابات للأدوية. ترتبط التغيرات في الميكروبيوم الطبيعي بالعائل بضعف الجهاز المناعي والأمراض المزمنة ، مثل أمراض التهاب الأمعاء والسرطان والسمنة ومرض السكري وحالات التمثيل الغذائي المرتبطة بالأمراض العصبية والقلب والأوعية الدموية والجهاز التنفسي.

يقدم هذا المقرر الدراسي مجال الميكروبيوم المضيف مع التركيز على الصحة ويناقش طرق دراسات الميكروبيوم وتحليل البيانات. تقدم الدورة لمحة عامة عن الجراثيم المرتبطة بالأمعاء البشرية والجهاز البولي التناسلي والفم والجلد بالإضافة إلى التفاعلات مع جهاز المناعة. تمت مناقشة دور اضطرابات الميكروبيوم في الخلل المناعي للمضيف والأمراض المزمنة وإمكانيات العلاج القائم على الميكروبيوم.

عند الانتهاء من الدورة ، يجب على الطالب أن يتعلم:

  • الطرق المستخدمة لدراسة الميكروبيوم ولتحليل البيانات
  • الميكروبات المرتبطة بالأمعاء والجهاز البولي التناسلي والفم والجلد
  • تفاعلات الجراثيم مع جهاز المناعة
  • آثار النظام الغذائي والعمر على الكائنات الحية الدقيقة
  • أهمية الجراثيم في صحة الإنسان والمرض
  • أهمية الجراثيم في الحيوانات والنباتات المستزرعة
  • تفاعلات الجراثيم مع الأدوية
  • الاتجاهات الحالية في تعديل الجراثيم

بالإضافة إلى المحاضرات عبر الإنترنت ، ستتاح للمشاركين أيضًا فرصة:


تنوع الجراثيم الجرثومية في حمض اللاكتيك المهبلي في 15 جزائرية حامل مصابات أو بدون التهاب المهبل البكتيري باستخدام طريقة الثقافة المستقلة

مقدمة: يعد التهاب المهبل البكتيري (BV) أكثر اضطرابات الجهاز التناسلي السفلي شيوعًا بين النساء في سن الإنجاب (الحوامل وغير الحوامل) ومعرفة أفضل عن اكتوباكيللوس هناك حاجة إلى ثراء الأنواع بالميكروبات المهبلية الصحية والمصابة بالعدوى لتصميم منتجات بروبيوتيك أفضل بكفاءة لتعزيز الحفاظ على النباتات الطبيعية مما يساعد على منع التهاب المهبل البكتيري.

هدف: لتقييم ومقارنة تنوع الأنواع البكتيرية لحمض اللاكتيك في النساء الحوامل المصابات بالتهاب المهبل البكتيري وبدونه.

المواد والأساليب: تم إجراء دراسة تجريبية خلال الفترة من نوفمبر 2014 إلى مارس 2015 في جامعة باجي مختار ، عنابة ، الجزائر. تم جمع مسحات مهبلية من 15 امرأة حامل تتراوح أعمارهن بين 19 و 35 سنة (متوسط ​​27.6 سنة ن = 15) يعشن في شرق الجزائر لزيارة خدمات أمراض النساء ، مستشفى عبد الله نوورية - البوني ، عنابة. كانت العينات المهبلية ملطخة بالجرام ، وتم تسجيلها بطريقة Nugent. تضمنت المجموعة حالات نساء مصابات بنباتات مهبلية صحية "طبيعية" ، مصابات بالبكتيريا المهبلية ونساء مصابات بالنباتات "المتوسطة". تم تحديد مجتمع LAB المهبلي من النساء الحوامل من خلال طريقة مستقلة عن الثقافة تعتمد على تغيير طبيعة الفصل الكهربائي للهلام المتدرج (DGGE) ، مع تسلسل الجين 16S rRNA.

نتائج: تنتمي غالبية LAB إلى الجنس اكتوباكيللوس تم العثور عليها في النباتات "الطبيعية" و "المتوسطة" (87.5٪ و 43.75٪ على التوالي) ، بينما تنتمي غالبية LAB إلى الجنس المكورات المعوية تم التعرف عليه في النساء المصابات بالتهاب المهبل الجرثومي والنباتات المتوسطة (60٪ و 46.75٪ على التوالي). أظهرت نتائجنا أن وجود iners الملبنة و اكتوباكيللوس دلبرويكي يعزز استقرار الجراثيم المهبلية.

استنتاج: هذه النتيجة تؤكد نتائج الدراسات السابقة التي تشير إلى أن حدوث الغلبة اكتوباكيللوس يرتبط سلبًا بحدوث التهاب المهبل البكتيري واستخدامه الحالي كبروبيوتيك. iners الملبنة و اكتوباكيللوس دلبرويكي يمكن تعريفها على أنها ضرورية للدفاع عن المهبل. بالإضافة الى، المكورات المعوية البرازية يمكن اعتباره مؤشرا على عدم توازن النظام البيئي المهبلي.

الكلمات الدالة: DGGE Enterococcus Lactic acid بكتيريا Lactobacillus التهابات المهبل.


علامات وأعراض التهابات الجهاز البولي التناسلي

غالبًا ما تسبب التهابات المسالك البولية التهاب المثانة (التهاب المثانة) أو مجرى البول (التهاب الإحليل). يمكن أن يترافق التهاب الإحليل مع التهاب المثانة ، ولكن يمكن أن يحدث أيضًا بسبب العدوى المنقولة جنسيًا. تشمل أعراض التهاب الإحليل عند الرجال الإحساس بالحرقان أثناء التبول ، وإفرازات من القضيب ، ودم في السائل المنوي أو البول. في النساء ، يرتبط التهاب الإحليل مع التبول المؤلم والمتكرر ، والإفرازات المهبلية ، والحمى ، والقشعريرة ، وآلام البطن. تتشابه أعراض التهاب المثانة مع أعراض التهاب الإحليل. عندما يحدث التهاب الإحليل بسبب أحد العوامل الممرضة التي تنتقل عن طريق الاتصال الجنسي ، يمكن أن تحدث أعراض إضافية تشمل الأعضاء التناسلية. يمكن أن تشمل هذه الحويصلات المؤلمة (البثور) والثآليل والقروح. التهاب الحالب ، عدوى نادرة تصيب الحالب ، يمكن أن تحدث أيضًا مع التهاب المثانة. يمكن أن تكون هذه الالتهابات حادة أو مزمنة.

التهاب الحويضة والكلية و التهاب كبيبات الكلى هي التهابات الكلى التي يحتمل أن تكون خطيرة. التهاب الحويضة والكلية هو عدوى تصيب إحدى الكليتين أو كليهما ، وقد تتطور من عدوى المسالك البولية السفلية ، وغالبًا ما تتأثر المسالك البولية العلوية ، بما في ذلك الحالب. تشمل علامات التهاب الحويضة والكلية وأعراضه الحمى والقشعريرة والغثيان والقيء وآلام أسفل الظهر والتبول المؤلم المتكرر. عادة ما يصبح التهاب الحويضة والكلية مزمنًا فقط في الأفراد الذين يعانون من تشوهات أو تلف في الكلى.

التهاب كبيبات الكلى هو التهاب في كبيبات النيفرون. تشمل الأعراض زيادة البروتين والدم في البول وزيادة ضغط الدم واحتباس السوائل مما يؤدي إلى وذمة في الوجه واليدين والقدمين. قد يكون التهاب كبيبات الكلى عدوى حادة أو يمكن أن يصبح مزمنًا.

تشمل العدوى التي تحدث داخل الهياكل التناسلية للذكور التهاب البربخ والتهاب الخصية والتهاب البروستاتا. الالتهابات البكتيرية قد تسبب التهاب البربخ ، يسمى التهاب البربخ. يسبب هذا الالتهاب ألمًا في كيس الصفن والخصيتين ، كما يمكن ملاحظة تورم الفخذ والاحمرار والجلد الدافئ في هذه المناطق. التهاب الخصية يسمى التهاب الخصية، يحدث عادة بسبب عدوى بكتيرية تنتشر من البربخ ، ولكن يمكن أن يكون أيضًا من مضاعفات النكاف ، وهو مرض فيروسي. تتشابه الأعراض مع أعراض التهاب البربخ ، وليس من غير المألوف أن يحدث كلاهما معًا ، وفي هذه الحالة تسمى الحالة التهاب الأوركيد البربخ. التهاب غدة البروستاتا يسمى التهاب البروستات، يمكن أن ينتج عن عدوى بكتيرية. تشمل علامات وأعراض التهاب البروستاتا الحمى والقشعريرة والألم في المثانة والخصيتين والقضيب. قد يعاني المرضى أيضًا من حرقان أثناء التبول وصعوبة في إفراغ المثانة والقذف المؤلم.

بسبب قربه من الخارج ، يعد المهبل موقعًا شائعًا للعدوى عند النساء. المصطلح العام لأي التهاب في المهبل هو التهاب المهبل. غالبًا ما يتطور التهاب المهبل نتيجة النمو المفرط للبكتيريا أو الفطريات التي تعيش عادةً في الأحياء المجهرية المهبلية ، على الرغم من أنه يمكن أن ينتج أيضًا عن العدوى بمسببات الأمراض العابرة. تسمى الالتهابات البكتيرية في المهبل بالبكتيريا التهاب المهبل، في حين أن الالتهابات الفطرية (تشمل عادة الكانديدا spp.) عدوي فطريهس. يمكن أن تشارك التغيرات الديناميكية التي تؤثر على الجراثيم الطبيعية ، وإنتاج الحمض ، وتغيرات الأس الهيدروجيني في بدء النمو المفرط للميكروبات وتطور التهاب المهبل. على الرغم من أن بعض الأفراد قد لا تظهر عليهم أعراض ، إلا أن التهاب المهبل والتهاب المهبل يمكن أن يترافق مع إفرازات ورائحة وحكة وحرقان.

مرض التهاب الحوض (PID) هي عدوى تصيب الأعضاء التناسلية الأنثوية بما في ذلك الرحم وعنق الرحم وقناتي فالوب والمبيض. أكثر مسببات الأمراض شيوعًا هي مسببات الأمراض البكتيرية التي تنتقل عن طريق الاتصال الجنسي النيسرية البنية و المتدثرة الحثرية. التهاب قناة فالوب يسمى التهاب البوق، هو أخطر أشكال مرض التهاب الحوض. يمكن أن تختلف أعراض مرض التهاب الحوض بين النساء وتشمل ألمًا في أسفل البطن ، وإفرازات مهبلية ، وحمى ، وقشعريرة ، وغثيان ، وإسهال ، وقيء ، وتبول مؤلم.

  • ما هي الظروف التي يمكن أن تنتج عن الالتهابات التي تصيب الجهاز البولي؟
  • ما هي بعض الأسباب الشائعة لالتهاب المهبل عند النساء؟

محتويات

على الرغم من أنه معروف على نطاق واسع باسم فلورا أو الميكروفلورا، هذه تسمية خاطئة من الناحية الفنية ، منذ جذر الكلمة النباتية يتعلق بالنباتات ، و الكائنات الحية يشير إلى المجموعة الكاملة من الكائنات الحية في نظام بيئي معين. في الآونة الأخيرة ، المصطلح الأنسب ميكروبيوتا يتم تطبيقه ، على الرغم من أن استخدامه لم يتغلب على الاستخدام الراسخ والاعتراف به النباتية فيما يتعلق بالبكتيريا والكائنات الحية الدقيقة الأخرى. كلا المصطلحين يستخدمان في أدبيات مختلفة. [4]

اعتبارًا من عام 2014 ، تم الإبلاغ في كثير من الأحيان في وسائل الإعلام الشعبية وفي الأدبيات العلمية عن وجود حوالي 10 أضعاف عدد الخلايا الميكروبية في جسم الإنسان مثل الخلايا البشرية ، واستند هذا الرقم إلى تقديرات أن الميكروبيوم البشري يحتوي على حوالي 100 تريليون بكتيري. الخلايا وأن الإنسان البالغ لديه عادة حوالي 10 تريليون خلية بشرية. [8] في عام 2014 ، نشرت الأكاديمية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة أسئلة وأجوبة شددت على أن عدد الخلايا الميكروبية وعدد الخلايا البشرية كلاهما تقديرات ، ولاحظت أن الأبحاث الحديثة قد توصلت إلى تقدير جديد لعدد الخلايا البشرية - ما يقرب من 37.2 تريليون خلية ، مما يعني أن نسبة الخلايا الميكروبية إلى البشرية ، إذا كان التقدير الأصلي لـ 100 تريليون خلية بكتيرية صحيحًا ، هو أقرب إلى 3: 1. [8] [9] في عام 2016 ، نشرت مجموعة أخرى تقديرًا جديدًا للنسبة تقريبيًا 1: 1 (1.3: 1 ، مع "عدم يقين بنسبة 25 ٪ وتباين بنسبة 53 ٪ عن تعداد الذكور المعياريين الذين يبلغ وزنهم 70 كجم "). [10] [3]

التقدير الأحدث هو نسبة 1.3 خلية بكتيرية لكل خلية بشرية واحدة في حين أن عدد العاثيات والفيروسات يفوق عدد الخلايا البكتيرية بترتيب من حيث الحجم على الأقل. يقدر عدد الجينات البكتيرية (بافتراض وجود 1000 نوع بكتيري في الأمعاء مع 2000 جين لكل نوع) بـ 2،000،000 جين ، أي 100 ضعف عدد ما يقرب من 20،000 جين بشري. [11]

تكمن مشكلة توضيح الميكروبيوم البشري في تحديد أعضاء المجتمع الميكروبي الذي يشمل البكتيريا وحقيقيات النوى والفيروسات. [12] يتم ذلك في المقام الأول باستخدام الدراسات القائمة على الحمض النووي ، على الرغم من إجراء الدراسات القائمة على الحمض النووي الريبي والبروتين والمستقلب. [12] [13] عادة ما يمكن تصنيف دراسات الميكروبيوم المعتمدة على الحمض النووي على أنها إما دراسات أمبليكون مستهدفة أو دراسات ميتاجينوميه بندقية حديثة. يركز الأول على جينات محددة معروفة وهو مفيد في المقام الأول من الناحية التصنيفية ، في حين أن الأخير هو نهج ميتاجينومي كامل يمكن استخدامه أيضًا لدراسة الإمكانات الوظيفية للمجتمع. [12] أحد التحديات الموجودة في دراسات الميكروبيوم البشري ، ولكن ليس في الدراسات الميتاجينومية الأخرى ، هو تجنب تضمين الحمض النووي للمضيف في الدراسة. [14]

بصرف النظر عن مجرد توضيح تكوين الميكروبيوم البشري ، فإن أحد الأسئلة الرئيسية المتعلقة بالميكروبيوم البشري هو ما إذا كان هناك "جوهر" ، أي ما إذا كانت هناك مجموعة فرعية من المجتمع يتم مشاركتها بين معظم البشر. [15] [16] إذا كان هناك نواة ، فسيكون من الممكن ربط بعض التراكيب المجتمعية بحالات المرض ، وهو أحد أهداف مشروع الميكروبيوم البشري. من المعروف أن الميكروبيوم البشري (مثل ميكروبيوتا الأمعاء) متغير بدرجة كبيرة سواء داخل موضوع واحد أو بين أفراد مختلفين ، وهي ظاهرة تُلاحظ أيضًا في الفئران. [4]

في 13 يونيو 2012 ، أعلن مدير المعاهد الوطنية للصحة فرانسيس كولينز عن معلم رئيسي لمشروع الميكروبيوم البشري (HMP). [7] وكان الإعلان مصحوبًا بسلسلة من المقالات المنسقة التي نُشرت في مجلة Nature [17] [18] والعديد من المجلات في المكتبة العامة للعلوم (PLoS) في نفس اليوم. من خلال رسم خرائط التركيب الميكروبي الطبيعي للبشر الأصحاء باستخدام تقنيات تسلسل الجينوم ، أنشأ باحثو HMP قاعدة بيانات مرجعية وحدود التباين الجرثومي الطبيعي لدى البشر. من 242 متطوعًا أمريكيًا يتمتعون بصحة جيدة ، تم جمع أكثر من 5000 عينة من أنسجة من 15 (رجالًا) إلى 18 (نساء) موقعًا للجسم مثل الفم والأنف والجلد والأمعاء السفلية (البراز) والمهبل. تم تحليل جميع الحمض النووي ، البشري والميكروبي ، باستخدام آلات تسلسل الحمض النووي. تم استخراج بيانات الجينوم الميكروبي عن طريق تحديد الحمض النووي الريبي الريبوسومي النوعي البكتيري ، 16S rRNA. حسب الباحثون أن أكثر من 10000 نوع ميكروبي تحتل النظام البيئي البشري وقد حددوا 81-99٪ من الأجناس.

تعديل تسلسل البندقية

غالبًا ما يكون من الصعب استزراع البكتيريا والعتيقات والفيروسات في المجتمعات المختبرية ، وبالتالي يمكن استغلال تقنيات التسلسل في علم الميتاجينوميات أيضًا. في الواقع ، توفر المعرفة الكاملة بوظائف وتوصيف سلالات ميكروبية معينة إمكانية كبيرة في الاكتشاف العلاجي وصحة الإنسان. [19]

جمع العينات وتحرير استخراج الحمض النووي

النقطة الرئيسية هي جمع كمية من الكتلة الحيوية الميكروبية كافية لأداء التسلسل وتقليل تلوث العينة لهذا السبب ، يمكن استخدام تقنيات التخصيب. على وجه الخصوص ، يجب أن تكون طريقة استخراج الحمض النووي جيدة لكل سلالة بكتيرية ، وليس للحصول على جينومات السلالات التي يسهل تحليلها. عادةً ما يُفضل التحلل الميكانيكي بدلاً من التحلل الكيميائي ، وقد يؤدي ضرب الخرزة إلى فقد الحمض النووي عند تحضير المكتبة. [19]

اعداد المكتبة وتحرير التسلسل

أكثر المنصات استخدامًا هي Illumina و Ion Torrent و Oxford Nanopore MinION و Pacific Bioscience Sequel ، على الرغم من أن منصة Illumina تعتبر الخيار الأكثر جاذبية نظرًا لتوفرها الواسع والإنتاجية العالية والدقة. لا توجد مؤشرات بخصوص الكمية الصحيحة للعينة المراد استخدامها. [19]

تحرير التجمع الميتاجينوم

ومع ذلك ، يتم استغلال نهج de novo ، فإنه يطرح بعض الصعوبات التي يجب التغلب عليها. تعتمد التغطية على وفرة كل جينوم في الجينومات منخفضة الوفرة في مجتمعها المحدد وقد تخضع للتجزئة إذا كان عمق التسلسل غير كافٍ لتجنب تكوين الفجوات. لحسن الحظ ، هناك مجمعات خاصة بالميتاجينوم للمساعدة ، لأنه في حالة وجود مئات السلالات ، يجب زيادة عمق التسلسل إلى أقصى حد. [19]

تحرير binning

لا يُعرف أي جينوم يُشتق منه كل كونتيج ، ولا عدد الجينومات الموجودة في العينة بداهة الهدف من هذه الخطوة هو تقسيم contigs إلى أنواع. يمكن أن تكون طرق إجراء مثل هذا التحليل إما تحت الإشراف (قاعدة بيانات ذات تسلسلات معروفة) أو غير خاضعة للإشراف (البحث المباشر عن مجموعات متصلة في البيانات المجمعة). ومع ذلك ، تتطلب كلتا الطريقتين نوعًا من المقياس لتحديد درجة التشابه بين كونتيج معين والمجموعة التي يجب وضعها فيها ، والخوارزميات لتحويل أوجه التشابه إلى تخصيصات في المجموعات. [19]

التحليل بعد المعالجة تحرير

يعد التحليل الإحصائي ضروريًا للتحقق من صحة النتائج التي تم الحصول عليها (يمكن استخدام ANOVA لتحديد حجم الاختلافات بين المجموعات) إذا تم إقرانها بأدوات رسومية ، يمكن تصور النتيجة وفهمها بسهولة. [19]

بمجرد تجميع الميتاجينوم ، من الممكن استنتاج الإمكانات الوظيفية للميكروبيوم. التحديات الحسابية لهذا النوع من التحليل أكبر من تلك التي تواجه الجينوم الفردي ، لأن مجمعات metagenomes عادة ما تكون ذات جودة رديئة ، والعديد من الجينات المستعادة غير كاملة أو مجزأة. بعد خطوة تحديد الجين ، يمكن استخدام البيانات لإجراء تعليق توضيحي وظيفي عن طريق المحاذاة المتعددة للجينات المستهدفة مقابل قواعد بيانات أخصائيي تقويم العظام. [20]

علامة التحليل الجيني تحرير

إنها تقنية تستغل البادئات لاستهداف منطقة وراثية معينة وتمكن من تحديد السلالات الجرثومية. تتميز المنطقة الجينية بمنطقة شديدة التباين والتي يمكن أن تمنح تحديدًا تفصيليًا ، يتم تحديدها بواسطة المناطق المحفوظة ، والتي تعمل كمواقع ربط للبادئات المستخدمة في تفاعل البوليميراز المتسلسل.الجين الرئيسي المستخدم لوصف البكتيريا والعتائق هو جين 16S rRNA ، بينما يعتمد تحديد الفطريات على فاصل النسخ الداخلي (ITS). هذه التقنية سريعة وليست باهظة الثمن وتمكن من الحصول على تصنيف منخفض الدقة لعينة ميكروبية ، وهي مثالية للعينات التي قد تكون ملوثة بالحمض النووي المضيف. يختلف تقارب التمهيدي بين جميع متواليات الحمض النووي ، مما قد يؤدي إلى تحيزات أثناء تفاعل التضخيم ، في الواقع ، تكون العينات منخفضة الوفرة عرضة لأخطاء التضخيم ، نظرًا لأن الكائنات الدقيقة الملوثة الأخرى تؤدي إلى زيادة التمثيل في حالة زيادة دورات PCR. لذلك ، يمكن أن يساعد تحسين اختيار التمهيدي في تقليل هذه الأخطاء ، على الرغم من أنه يتطلب معرفة كاملة بالكائنات الحية الدقيقة الموجودة في العينة ، ووفرة النسبية لها. [21]

يمكن أن يتأثر التحليل الجيني للعلامة باختيار التمهيدي في هذا النوع من التحليل ، فمن المستحسن استخدام بروتوكول تم التحقق من صحته جيدًا (مثل ذلك المستخدم في مشروع Earth Microbiome). أول شيء يجب القيام به في تحليل amplicon الجيني للعلامة هو إزالة أخطاء التسلسل ، حيث أن الكثير من منصات التسلسل موثوقة للغاية ، ولكن معظم تنوع التسلسل الظاهر لا يزال بسبب أخطاء أثناء عملية التسلسل. لتقليل هذه الظاهرة ، تتمثل الطريقة الأولى في تجميع التسلسلات العنقودية في وحدة التصنيف التشغيلية (OTUs): تدمج هذه العملية التسلسلات المتشابهة (عادةً ما يتم اعتماد عتبة تشابه بنسبة 97 ٪) في ميزة واحدة يمكن استخدامها في خطوات التحليل الإضافية ، ولكن هذه الطريقة قد تجاهل SNPs لأنها ستتجمع في وحدة OTU واحدة. نهج آخر هو Oligotyping ، والذي يتضمن معلومات خاصة بالموقع من تسلسل الرنا الريباسي 16 ثانية لاكتشاف الاختلافات الصغيرة للنيوكليوتيدات ومن التمييز بين الأصناف المتميزة وثيقة الصلة. تعطي هذه الطرق كناتج جدولًا لتسلسلات الحمض النووي وأعداد التسلسلات المختلفة لكل عينة بدلاً من OTU. [21]

خطوة أخرى مهمة في التحليل هي تعيين اسم تصنيفي للتسلسلات الميكروبية في البيانات. يمكن القيام بذلك باستخدام مناهج التعلم الآلي التي يمكن أن تصل إلى دقة على مستوى الجنس تبلغ حوالي 80٪. توفر حزم التحليل الشائعة الأخرى دعمًا للتصنيف التصنيفي باستخدام المطابقات التامة لقواعد البيانات المرجعية ويجب أن توفر قدرًا أكبر من التحديد ، ولكن الحساسية الضعيفة. يجب إجراء مزيد من الفحص للكائنات الحية الدقيقة غير المصنفة بحثًا عن تسلسل العضية. [21]

تحرير تحليل النشوء والتطور

تستخدم العديد من الطرق التي تستغل الاستدلال الوراثي جين 16SRNA لـ Archea والبكتيريا وجين 18SRNA لحقيقيات النوى. تعتمد طرق المقارنة الوراثية (PCS) على مقارنة سمات متعددة بين الكائنات الحية الدقيقة ، والمبدأ هو: كلما كانت مرتبطة ارتباطًا وثيقًا ، زاد عدد السمات التي تشترك فيها. عادةً ما تقترن أجهزة الكمبيوتر الشخصية بالمربعات الصغرى المعممة للتطور الوراثي (PGLS) أو غيرها من التحليلات الإحصائية للحصول على نتائج أكثر أهمية. تُستخدم إعادة بناء حالة الأسلاف في دراسات الميكروبيوم لإسناد قيم السمات للأصناف التي تكون سماتها غير معروفة. يتم إجراء هذا بشكل شائع باستخدام PICRUSt ، والذي يعتمد على قواعد البيانات المتاحة. يتم اختيار المتغيرات التطورية من قبل الباحثين وفقًا لنوع الدراسة: من خلال اختيار بعض المتغيرات ذات المعلومات البيولوجية المهمة ، من الممكن تقليل أبعاد البيانات المراد تحليلها. [22]

عادةً ما يتم إجراء مسافة المعرفة بالتطور الوراثي باستخدام UniFrac أو أدوات مماثلة ، مثل مؤشر Soresen أو Rao's D ، لتحديد الاختلافات بين المجتمعات المختلفة. تتأثر كل هذه الطرق سلبًا بنقل الجينات الأفقي (HGT) ، حيث يمكن أن تولد أخطاء وتؤدي إلى ارتباط الأنواع البعيدة. هناك طرق مختلفة لتقليل التأثير السلبي لـ HGT: استخدام جينات متعددة أو أدوات حسابية لتقييم احتمالية أحداث HGT المفترضة. [22]

تحرير البكتيريا

تعيش الميكروبات (مثل البكتيريا والخمائر) في الجلد والأسطح المخاطية في أجزاء مختلفة من الجسم. يشكل دورها جزءًا من فسيولوجيا الإنسان الطبيعية والصحية ، ولكن إذا زادت أعداد الميكروبات عن نطاقاتها النموذجية (غالبًا بسبب ضعف جهاز المناعة) أو إذا كانت الميكروبات تتكاثر (مثل سوء النظافة أو الإصابة) في مناطق الجسم غير المستعمرة عادةً أو عقيم (مثل الدم ، أو الجهاز التنفسي السفلي ، أو تجويف البطن) ، يمكن أن ينتج عن المرض (يسبب ، على التوالي ، تجرثم الدم / تعفن الدم ، والالتهاب الرئوي ، والتهاب الصفاق). [ هناك حاجة إلى الاقتباس الطبي ]

وجد مشروع Human Microbiome أن الأفراد يستضيفون آلاف الأنواع البكتيرية ، ومواقع مختلفة من الجسم لها مجتمعاتهم المميزة. أظهرت مواقع الجلد والمهبل تنوعًا أصغر من الفم والأمعاء ، وهي تظهر ثراء أكبر. يختلف التركيب البكتيري لموقع معين على الجسم من شخص لآخر ، ليس فقط من حيث النوع ، ولكن أيضًا بكثرة. البكتيريا من نفس النوع الموجودة في جميع أنحاء الفم من أنواع فرعية متعددة ، مفضلة أن تسكن مواقع مختلفة بشكل واضح في الفم. حتى الأنماط المعوية في الأمعاء البشرية ، والتي كان يُعتقد سابقًا أنها مفهومة جيدًا ، هي من طيف واسع من المجتمعات ذات حدود تصنيفية غير واضحة. [23] [24]

تشير التقديرات إلى أن ما بين 500 إلى 1000 نوع من البكتيريا تعيش في أمعاء الإنسان ولكنها تنتمي إلى عدد قليل من الشُّعَب: تهيمن العناصر الثابتة والجراثيم ولكن هناك أيضًا بكتيريا بروتيوبكتريا وفيروكوميكروبيا وأكتينوبكتيريا وفوسوباكتيريا وسيانوبكتيريا. [25]

وهناك عدد من أنواع البكتيريا مثل الشعيات اللزجة و أ، تعيش في الفم ، حيث تكون جزءًا من مادة لزجة تسمى البلاك. إذا لم يتم إزالتها عن طريق الفرشاة ، فإنها تتصلب في التفاضل والتكامل (وتسمى أيضًا الجير). تفرز البكتيريا نفسها أيضًا الأحماض التي تذوب مينا الأسنان ، مما يتسبب في تسوس الأسنان.

تتكون البكتيريا المهبلية في الغالب من أنواع مختلفة من العصيات اللبنية. كان يعتقد منذ فترة طويلة أن أكثر هذه الأنواع شيوعًا هو الملبنة الحمضة، ولكن تبين لاحقًا أن L. iners هو في الواقع الأكثر شيوعًا ، يليه كريسباتوس. توجد العصيات اللبنية الأخرى الموجودة في المهبل L. jensenii، L. delbruekii و L. gasseri. يمكن أن يؤدي اضطراب الفلورا المهبلية إلى عدوى مثل التهاب المهبل الجرثومي أو داء المبيضات ("عدوى الخميرة").

تحرير العتائق

توجد العتائق في الأمعاء البشرية ، ولكن على عكس التنوع الهائل للبكتيريا في هذا العضو ، فإن أعداد الأنواع البدائية محدودة للغاية. [26] المجموعة المهيمنة هي الميثانوجينات على وجه الخصوص ميثانوبريفيباكتر سميثي و Methanosphaera stadtmanae. [27] ومع ذلك ، فإن الاستعمار بواسطة الميثانوجينات متغير ، وحوالي 50٪ فقط من البشر لديهم مجموعات يسهل اكتشافها من هذه الكائنات. [28]

اعتبارًا من عام 2007 ، لم يتم التعرف على أمثلة واضحة لمسببات الأمراض البدائية ، [29] [30] على الرغم من اقتراح وجود علاقة بين وجود بعض الميثانوجينات وأمراض اللثة البشرية. [31]

تحرير الفطريات

الفطريات ، ولا سيما الخميرة ، موجودة في أمعاء الإنسان. [32] [33] [34] [35] أفضل هذه الدراسات هي الكانديدا بسبب قدرتها على أن تصبح مسببة للأمراض في نقص المناعة وحتى في المضيفين الأصحاء. [33] [34] [35] توجد الخميرة أيضًا على الجلد ، [32] مثل ملاسيزية الأنواع ، حيث تستهلك الزيوت التي تفرز من الغدد الدهنية. [36] [37]

تحرير الفيروسات

تستعمر الفيروسات ، وخاصة الفيروسات البكتيرية (العاثيات) ، مواقع الجسم المختلفة. تشمل هذه المواقع المستعمرة الجلد ، [38] الأمعاء ، [39] الرئتين ، [40] وتجويف الفم. [41] ارتبطت مجتمعات الفيروسات ببعض الأمراض ، وهي لا تعكس ببساطة المجتمعات البكتيرية. [42] [43] [44]

تحرير الجلد

وجدت دراسة أجريت على 20 موقعًا جلديًا على كل من عشرة أشخاص أصحاء ، 205 أجناسًا محددة في 19 شعبة بكتيرية ، مع تحديد معظم التسلسلات لأربعة شُعَب: البكتيريا الشعاعية (51.8٪) ، الثبات (24.4٪) ، البروتيوباكتيريا (16.5٪) ، والبكتيريا ( 6.3٪). [٤٥] يوجد عدد كبير من الأجناس الفطرية على جلد الإنسان السليم ، مع بعض التباين حسب منطقة الجسم ، ومع ذلك ، أثناء الحالات المرضية ، تميل بعض الأجناس إلى السيطرة في المنطقة المصابة. [32] على سبيل المثال ، ملاسيزية هو المهيمن في التهاب الجلد التأتبي و أكريمونيوم هو المسيطر على فروة الرأس المصابة بقشرة الرأس. [32]

يعمل الجلد كحاجز لردع غزو الميكروبات المسببة للأمراض. يحتوي جلد الإنسان على ميكروبات تعيش إما في الجلد أو عليه ويمكن أن تكون داخلية أو عابرة. تختلف أنواع الكائنات الحية الدقيقة المقيمة فيما يتعلق بنوع الجلد على جسم الإنسان. توجد غالبية الميكروبات على الخلايا السطحية على الجلد أو تفضل الارتباط بالغدد. هذه الغدد مثل الغدد الدهنية أو العرقية تزود الميكروبات بالماء والأحماض الأمينية والأحماض الدهنية. بالإضافة إلى ذلك ، غالبًا ما تكون البكتيريا المقيمة المرتبطة بالغدد الدهنية إيجابية الجرام ويمكن أن تكون مسببة للأمراض. [2]

تحرير الملتحمة

عادة ما يوجد عدد قليل من البكتيريا والفطريات في الملتحمة. [32] [46] تشتمل فئات البكتيريا على مكورات موجبة الجرام (على سبيل المثال ، المكورات العنقودية والمكورات العقدية) والقضبان سالبة الجرام والمكورات (على سبيل المثال ، المستدمية و النيسرية) حاضرون. [46] تشمل الأجناس الفطرية الكانديدا, فطر الرشاشيات، و بنسيليوم. [32] تفرز الغدد الدمعية باستمرار ، مما يحافظ على رطوبة الملتحمة ، بينما يؤدي الوميض المتقطع إلى تزييت الملتحمة ويزيل المواد الغريبة. تحتوي الدموع على مبيدات الجراثيم مثل الليزوزيم ، بحيث تواجه الكائنات الدقيقة صعوبة في البقاء على قيد الحياة من الليزوزيم والاستقرار على الأسطح الظهارية.

تحرير الجهاز الهضمي

في البشر ، يتم تحديد تكوين ميكروبيوم الجهاز الهضمي أثناء الولادة. [51] تؤثر الولادة القيصرية أو الولادة المهبلية أيضًا على التركيب الميكروبي للأمعاء. الأطفال الذين يولدون من خلال القناة المهبلية لديهم ميكروبات أمعاء مفيدة غير مسببة للأمراض مماثلة لتلك الموجودة في الأم. [52] ومع ذلك ، فإن الميكروبات المعوية للأطفال الذين يولدون عن طريق القسم C تأوي المزيد من البكتيريا المسببة للأمراض مثل Escherichia coli و Staphylococcus وتستغرق وقتًا أطول لتطوير مجهريات الأمعاء المفيدة غير المسببة للأمراض. [53]

العلاقة بين بعض النباتات المعوية والبشر ليست مجرد علاقة تعايشية (تعايش غير ضار) ، بل علاقة متبادلة. [2] تفيد بعض الكائنات الحية الدقيقة في الأمعاء البشرية المضيف عن طريق تخمير الألياف الغذائية إلى أحماض دهنية قصيرة السلسلة (SCFAs) ، مثل حمض الأسيتيك وحمض الزبد ، والتي يمتصها المضيف بعد ذلك. [4] [54] تلعب البكتيريا المعوية أيضًا دورًا في تصنيع فيتامين ب وفيتامين ك بالإضافة إلى استقلاب الأحماض الصفراوية والستيرولات والمواد الغريبة الحيوية. [2] [54] الأهمية النظامية لـ SCFAs والمركبات الأخرى التي تنتجها تشبه الهرمونات ويبدو أن فلورا الأمعاء نفسها تعمل كعضو من أعضاء الغدد الصماء ، [54] وقد ارتبط عدم انتظام فلورا الأمعاء بمجموعة من الالتهابات وظروف المناعة الذاتية. [4] [55]

يتغير تكوين فلورا الأمعاء البشرية بمرور الوقت ، عندما يتغير النظام الغذائي ، ومع تغيرات الصحة العامة. [4] [55] وجدت مراجعة منهجية لـ 15 تجربة بشرية عشوائية محكومة من يوليو 2016 أن بعض السلالات المتاحة تجاريًا من بكتيريا بروبيوتيك من Bifidobacterium و اكتوباكيللوس أجناس (ب. لونغوم, بريف, ب. الرضع, L. helveticus, L. rhamnosus, L. الأخمصية، و L. كازي) ، عندما تؤخذ عن طريق الفم بجرعات يومية من 10 9-10 10 وحدات تشكيل مستعمرة (CFU) لمدة 1-2 شهر ، تمتلك فعالية علاجية (أي تحسن النتائج السلوكية) في بعض اضطرابات الجهاز العصبي المركزي - بما في ذلك القلق والاكتئاب والتوحد اضطراب الطيف والوسواس القهري - ويحسن جوانب معينة من الذاكرة. [56] ومع ذلك ، فقد وجد أيضًا أن التغيرات في تكوين الكائنات الحية الدقيقة في الأمعاء مرتبطة بالتأثيرات الضارة على الصحة. في مقال نشره موسو وآخرون ، وجد أن ميكروبيوتا الأمعاء لدى الأفراد الذين يعانون من السمنة المفرطة تحتوي على مواد أكثر ثباتًا وأقل من البكتيريا من الأفراد الأصحاء. [57] يُعتقد أن هذا التغيير في نسبة الميكروبات قد يساهم في زيادة البكتيريا بشكل أكثر كفاءة في استخلاص الطاقة من الطعام. استخدم الباحثون تسلسل البندقية لمقارنة ميكروبيوتا الفئران البدينة بالفئران الخالية من الدهون. ووجدوا أن جينومات الفئران البدينة تتكون من وفرة من الجينات المشفرة للإنزيمات القادرة على تكسير السكريات التي لا يهضمها جسم الإنسان وحده. [58]

علاوة على ذلك ، أكدت دراسة أجراها جوردون وزملاؤه أن تكوين الميكروبات هو الذي يسبب السمنة وليس العكس. وقد تم ذلك عن طريق زرع ميكروبات الأمعاء من الفئران البدينة التي يسببها النظام الغذائي (DIO) أو الفئران الخالية من الدهون في الفئران الخالية من الجراثيم الخالية من الجراثيم والتي لا تحتوي على ميكروبيوم. ووجدوا أن الفئران المزروعة بميكروبات أمعاء الفئران DIO تحتوي على دهون كلية أعلى بكثير من الفئران المزروعة بميكروبات الفئران الخالية من الدهون عندما تتغذى على نفس النظام الغذائي. [59]

دراسة منفصلة ، أكملها Ridaura وآخرون. في عام 2013 ، تم إجراء أول عملية زرع براز بشري في فئران خالية من الجراثيم. نشأ البراز البشري الذي تم جمعه من توائم إناث بالغة مع نسب دهون مختلفة بشكل ملحوظ في الجسم. تمكن الباحثون بشكل أساسي من نقل النمط الظاهري للسمنة والنمط الظاهري النحيف إلى الفئران ، بينما كان كلاهما يتغذى على الفئران قليلة الدسم. وزادت الفئران المصابة بالبراز المستمدة من التوأم البدين من كتلة الجسم والدهون الكلية ، في حين أن الفئران المصابة ببراز مشتق من التوأم الأقل رشاقة لم تظهر عليها سمات أو أعراض شبيهة بالسمنة. [60]

تحرير مجرى البول والمثانة

يبدو أن الجهاز البولي التناسلي يحتوي على ميكروبيوتا ، [61] [62] وهو اكتشاف غير متوقع في ضوء الاستخدام طويل الأمد لطرق الزراعة الميكروبيولوجية السريرية القياسية للكشف عن البكتيريا في البول عندما يظهر الناس علامات عدوى في المسالك البولية. من الشائع أن تظهر هذه الاختبارات عدم وجود بكتيريا. [63] يبدو أن طرق الاستنبات الشائعة لا تكتشف أنواعًا كثيرة من البكتيريا والكائنات الحية الدقيقة الأخرى الموجودة بشكل طبيعي. [63] اعتبارًا من عام 2017 ، تم استخدام طرق التسلسل لتحديد هذه الكائنات الدقيقة لتحديد ما إذا كانت هناك اختلافات في الكائنات الحية الدقيقة بين الأشخاص الذين يعانون من مشاكل في المسالك البولية والذين يتمتعون بصحة جيدة. [61] [62] لتقييم ميكروبيوم المثانة بشكل صحيح على عكس الجهاز البولي التناسلي ، يجب جمع عينة البول مباشرة من المثانة ، والذي يتم غالبًا باستخدام قسطرة. [64]

تحرير المهبل

تشير الجراثيم المهبلية إلى تلك الأنواع والأجناس التي تستعمر المهبل. تلعب هذه الكائنات دورًا مهمًا في الحماية من العدوى والحفاظ على صحة المهبل. [65] الكائنات الدقيقة المهبلية الأكثر وفرة في النساء قبل انقطاع الطمث هي من الجنس اكتوباكيللوس، الذي يقمع مسببات الأمراض عن طريق إنتاج بيروكسيد الهيدروجين وحمض اللاكتيك. [34] [65] [66] يختلف تكوين الأنواع البكتيرية ونسبها تبعًا لمرحلة الدورة الشهرية. [67] [68] [ يحتاج التحديث ] يؤثر العرق أيضًا على الفلورا المهبلية. يكون حدوث العصيات اللبنية المنتجة لبيروكسيد الهيدروجين أقل عند النساء الأميركيات من أصول إفريقية ويكون الرقم الهيدروجيني المهبلي أعلى. [69] تم ربط العوامل المؤثرة الأخرى مثل الاتصال الجنسي والمضادات الحيوية بفقدان العصيات اللبنية. [66] علاوة على ذلك ، فقد وجدت الدراسات أن الجماع باستخدام الواقي الذكري يبدو أنه يغير مستويات العصيات اللبنية ، ويزيد من مستوى الإشريكية القولونية داخل الفلورا المهبلية. [66] التغيرات في الجراثيم المهبلية الطبيعية والصحية هي مؤشر على وجود عدوى ، [70] مثل داء المبيضات أو التهاب المهبل الجرثومي. [66] المبيضات البيض يمنع نمو اكتوباكيللوس الأنواع ، بينما اكتوباكيللوس الأنواع التي تنتج بيروكسيد الهيدروجين تمنع نمو وفوعة المبيضات البيض في كل من المهبل والأمعاء. [32] [34] [35]

تشمل الأجناس الفطرية التي تم اكتشافها في المهبل الكانديدا, بيتشيا, يوروتيوم, النوباء, رودوتورولا، و كلادوسبوريوم، من بين أمور أخرى. [32]

تحرير المشيمة

حتى وقت قريب ، كانت المشيمة تعتبر عضوًا معقمًا ، ولكن تم التعرف على الأنواع البكتيرية المتعايشة وغير المسببة للأمراض والأجناس الموجودة في أنسجة المشيمة. [71] [72] [73]

تحرير الرحم

حتى وقت قريب ، كان الجهاز التناسلي العلوي عند النساء يعتبر بيئة معقمة. تعيش مجموعة متنوعة من الكائنات الحية الدقيقة في رحم النساء اللائي لا تظهر عليهن أعراض في سن الإنجاب. يختلف ميكروبيوم الرحم اختلافًا كبيرًا عن الميكروبيوم في المهبل والجهاز الهضمي. [74]

تحرير تجويف الفم

تسمح البيئة الموجودة في فم الإنسان بنمو الكائنات الحية الدقيقة المميزة الموجودة هناك. يوفر مصدرًا للمياه والمغذيات ، فضلاً عن درجة حرارة معتدلة. [2] تلتصق الميكروبات المقيمة بالفم بالأسنان واللثة لمقاومة التدفق الميكانيكي من الفم إلى المعدة حيث يتم تدمير الميكروبات الحساسة للحمض بواسطة حمض الهيدروكلوريك. [2] [34]

تشمل البكتيريا اللاهوائية في تجويف الفم ما يلي: الشعيات, أراكنيا, باكتيرويدس, Bifidobacterium, يوبكتيريوم, المغزلية, اكتوباكيللوس, ليبتوتريشيا, المكورات العقدية, الببتوستربتوكوكس, Propionibacterium, سيلينوموناس, اللولبية، و فيلونيلا. [75] [ يحتاج التحديث ] أجناس الفطريات التي توجد بشكل متكرر في الفم تشمل الكانديدا, كلادوسبوريوم, فطر الرشاشيات, الفيوزاريوم, جلوموس, النوباء, بنسيليوم، و المستخفية، من بين أمور أخرى. [32]

تتراكم البكتيريا على كل من أنسجة الفم الصلبة واللينة في البيوفيلم مما يسمح لها بالالتصاق والسعي في بيئة الفم مع الحماية من العوامل البيئية والعوامل المضادة للميكروبات. [76] يلعب اللعاب دورًا رئيسيًا في استتباب البيوفيلم ، مما يسمح بإعادة استعمار البكتيريا لتشكيل والتحكم في النمو عن طريق فصل تراكم الأغشية الحيوية. [77] كما أنه يوفر وسيلة لتنظيم المواد الغذائية ودرجة الحرارة. يحدد موقع البيوفيلم نوع العناصر الغذائية المكشوفة التي يتلقاها. [78]

طورت البكتيريا الفموية آليات لاستشعار بيئتها والتهرب من العائل أو تعديله. ومع ذلك ، فإن نظام دفاع مضيف فطري عالي الكفاءة يراقب باستمرار الاستعمار البكتيري ويمنع الغزو البكتيري للأنسجة المحلية. يوجد توازن ديناميكي بين بكتيريا لوحة الأسنان ونظام الدفاع الفطري للمضيف. [79]

تلعب هذه الديناميكية بين تجويف الفم المضيف وميكروبات الفم دورًا رئيسيًا في الصحة والمرض لأنها توفر الدخول إلى الجسم. [80] يقدم التوازن الصحي علاقة تكافلية حيث تحد ميكروبات الفم من نمو مسببات الأمراض والالتزام بها بينما يوفر المضيف بيئة لها لتزدهر. [80] [76] التغيرات البيئية مثل تغير حالة المناعة وتحول الميكروبات المقيمة وتوافر المغذيات تتحول من علاقة متبادلة إلى علاقة طفيلية مما يؤدي إلى تعرض المضيف لأمراض الفم والجهازية.[76] ترتبط الأمراض الجهازية مثل مرض السكري وأمراض القلب والأوعية الدموية بسوء صحة الفم. [80] من الأهمية بمكان دور الكائنات الحية الدقيقة الفموية في مرضي الأسنان الرئيسيين: تسوس الأسنان وأمراض اللثة. [79] يتسبب استعمار العوامل الممرضة في اللثة في استجابة مناعية مفرطة مما يؤدي إلى وجود جيب حول الأسنان - وهو فراغ عميق بين السن واللثة. [76] هذا بمثابة خزان محمي غني بالدم مع العناصر الغذائية لمسببات الأمراض اللاهوائية. [76] يمكن أن ينتج المرض الجهازي في مواقع مختلفة من الجسم عن دخول ميكروبات الفم إلى الدم متجاوزة الجيوب اللثوية والأغشية الفموية. [80]

نظافة الفم السليمة المستمرة هي الطريقة الأساسية للوقاية من أمراض الفم والجهازية. [80] يقلل من كثافة الأغشية الحيوية وزيادة نمو البكتيريا المسببة للأمراض مما يؤدي إلى الإصابة بالمرض. [78] ومع ذلك ، فإن نظافة الفم السليمة قد لا تكون كافية لأن الميكروبيوم الفموي والجينات والتغيرات في الاستجابة المناعية تلعب دورًا في الإصابة بالعدوى المزمنة. [78] استخدام المضادات الحيوية يمكن أن يعالج العدوى المنتشرة بالفعل ولكنه غير فعال ضد البكتيريا داخل الأغشية الحيوية. [78]

تحرير الرئة

يشبه إلى حد كبير تجويف الفم ، يمتلك الجهاز التنفسي العلوي والسفلي وسائل ردع ميكانيكية لإزالة الميكروبات. تنتج الخلايا الكأسية مخاطًا يحبس الميكروبات ويخرجها من الجهاز التنفسي عن طريق تحريك الخلايا الظهارية الهدبية باستمرار. [2] بالإضافة إلى ذلك ، ينتج تأثير مبيد للجراثيم عن طريق مخاط الأنف الذي يحتوي على إنزيم الليزوزيم. [2] يبدو أن الجهاز التنفسي العلوي والسفلي يحتويان على مجموعته الخاصة من الجراثيم. [81] تنتمي الجراثيم البكتيرية الرئوية إلى 9 أجناس بكتيرية رئيسية: بريفوتيلا, سفينغوموناس, الزائفة, Acinetobacter, المغزلية, Megasphaera, فيلونيلا, المكورات العنقودية، و العقدية. يمكن لبعض البكتيريا التي تعتبر "حيويًا طبيعيًا" في الجهاز التنفسي أن تسبب مرضًا خطيرًا خاصةً في الأفراد الذين يعانون من نقص المناعة ، وتشمل هذه الأبراج العقدية, المستدمية النزلية, العقدية الرئوية, النيسرية السحائية، و المكورات العنقودية الذهبية. [ بحاجة لمصدر ] الأجناس الفطرية التي تتكون منها الفطريات الرئوية تشمل الكانديدا, ملاسيزية, نيوسارتوريا, السكريات، و فطر الرشاشيات، من بين أمور أخرى. [32]

لوحظ توزيع غير عادي للأجناس البكتيرية والفطرية في الجهاز التنفسي لدى الأشخاص المصابين بالتليف الكيسي. [32] [82] غالبًا ما تحتوي النباتات البكتيرية على بكتيريا مقاومة للمضادات الحيوية وبطيئة النمو ، ويتغير تواتر هذه العوامل الممرضة فيما يتعلق بالعمر. [82]

تحرير القناة الصفراوية

تقليديا ، اعتبرت القناة الصفراوية معقمة بشكل طبيعي ، ووجود الكائنات الحية الدقيقة في الصفراء هو علامة على العملية المرضية. تم تأكيد هذا الافتراض بالفشل في تخصيص السلالات البكتيرية من القناة الصفراوية الطبيعية. بدأت الأوراق في الظهور في عام 2013 تُظهر أن الكائنات الدقيقة الصفراوية الطبيعية هي طبقة وظيفية منفصلة تحمي القناة الصفراوية من استعمار الكائنات الحية الدقيقة الخارجية. [83]

تعتمد أجسام الإنسان على عدد لا يحصى من الجينات البكتيرية كمصدر للعناصر الغذائية الأساسية. [84] تشير كل من الدراسات الميتاجينومية والوبائية إلى الأدوار الحيوية للميكروبيوم البشري في الوقاية من مجموعة واسعة من الأمراض ، من مرض السكري من النوع 2 والسمنة إلى مرض التهاب الأمعاء ، ومرض باركنسون ، وحتى حالات الصحة العقلية مثل الاكتئاب. [85] العلاقة التكافلية بين ميكروبيوتا الأمعاء والبكتيريا المختلفة قد تؤثر على الاستجابة المناعية للفرد. [86] على الرغم من أن العلاج القائم على الميكروبيوم في مهده ، إلا أنه يبشر بالخير أيضًا ، وعلى الأخص في علاج مقاومة الأدوية جيم صعب العدوى [87] وفي علاج مرض السكري. [88]

المطثيات العسيرة عدوى تحرير

وجود ساحق للبكتيريا ، جيم صعب ، يؤدي إلى عدوى في الجهاز الهضمي ، ترتبط عادةً بخلل التنسج مع الجراثيم التي يُعتقد أنها ناجمة عن إعطاء المضادات الحيوية. يقضي استخدام المضادات الحيوية على بكتيريا الأمعاء المفيدة داخل الجهاز الهضمي ، والتي تمنع عادةً البكتيريا المسببة للأمراض من ترسيخ الهيمنة. [89] العلاج التقليدي ل جيم صعب تشمل العدوى نظامًا إضافيًا من المضادات الحيوية ، ومع ذلك ، فإن معدلات الفعالية تتراوح بين 20-30 ٪. [90] إدراكًا لأهمية بكتيريا الأمعاء الصحية ، لجأ الباحثون إلى إجراء يُعرف باسم زرع جراثيم البراز ، حيث يعاني المرضى من أمراض الجهاز الهضمي ، مثل جيم صعب العدوى ، تلقي محتوى براز من فرد سليم على أمل استعادة البكتيريا المعوية التي تعمل بشكل طبيعي. [91] زرع جراثيم البراز فعال بنسبة 85-90٪ تقريبًا في الأشخاص الذين يعانون من CDI الذين لم تنجح معهم المضادات الحيوية أو الذين يتكرر المرض لديهم بعد تناول المضادات الحيوية. [92] [93] يتعافى معظم الأشخاص الذين يعانون من CDI مع علاج FMT واحد. [94] [95] [96]

تحرير السرطان

على الرغم من أن السرطان بشكل عام مرض وراثي وعوامل بيئية ، فإن الكائنات الحية الدقيقة متورطة في حوالي 20 ٪ من السرطانات البشرية. [97] بشكل خاص للعوامل المحتملة في سرطان القولون ، كثافة البكتيريا أعلى بمليون مرة من الأمعاء الدقيقة ، ويحدث ما يقرب من 12 ضعفًا من السرطانات في القولون مقارنة بالأمعاء الدقيقة ، مما قد يؤدي إلى إنشاء دور ممرض للميكروبات في القولون وسرطانات المستقيم. [98] يمكن استخدام الكثافة الميكروبية كأداة تشخيصية في تقييم سرطانات القولون والمستقيم. [98]

قد تؤثر الجراثيم على التسرطن بثلاث طرق واسعة: (1) تغيير توازن تكاثر الخلايا السرطانية والموت ، (2) تنظيم وظيفة الجهاز المناعي ، و (3) التأثير على استقلاب العوامل والأطعمة والمستحضرات الصيدلانية التي ينتجها المضيف. [97] الأورام التي تظهر على الأسطح الحدودية ، مثل الجلد والبلعوم والجهاز التنفسي والجهاز الهضمي والجهاز البولي التناسلي ، تأوي الكائنات الحية الدقيقة. إن التواجد الجوهري للميكروبات في موقع الورم لا ينشئ ارتباطًا أو روابط سببية. بدلاً من ذلك ، قد تجد الميكروبات توتر أكسجين الورم أو ملف المغذيات داعمًا. قد يؤدي أيضًا انخفاض عدد الميكروبات المحددة أو الإجهاد التأكسدي إلى زيادة المخاطر. [97] [98] من بين حوالي 10 30 ميكروبًا على الأرض ، تم تصنيف عشرة من قبل الوكالة الدولية لأبحاث السرطان كمواد مسرطنة للبشر. [97] قد تفرز الميكروبات البروتينات أو العوامل الأخرى التي تؤدي مباشرة إلى تكاثر الخلايا في المضيف ، أو قد ترفع أو تخفض من تنظيم الجهاز المناعي للمضيف بما في ذلك دفع الالتهاب الحاد أو المزمن بطرق تساهم في التسرطن. [97]

فيما يتعلق بالعلاقة بين وظيفة المناعة وتطور الالتهاب ، فإن حواجز سطح الغشاء المخاطي معرضة للمخاطر البيئية ويجب إصلاحها بسرعة للحفاظ على التوازن. كما تقلل مرونة المضيف أو الكائنات الحية الدقيقة من مقاومة الأورام الخبيثة ، مما قد يؤدي إلى حدوث التهاب وسرطان. بمجرد اختراق الحواجز ، يمكن للميكروبات استنباط برامج تحريضية أو مثبطة للمناعة من خلال مسارات مختلفة. [97] على سبيل المثال ، يبدو أن الميكروبات المرتبطة بالسرطان تعمل على تنشيط إشارات NF-داخل الخلية الميكروية للورم. مستقبلات التعرف على الأنماط الأخرى ، مثل أفراد عائلة مستقبلات قليلة القلة المرتبطة بالنيوكليوتيدات (NLR) NOD-2, NLRP3, NLRP6 و NLRP12، قد تلعب دورًا في التوسط في سرطان القولون والمستقيم. [97] بالمثل هيليكوباكتر بيلوري يبدو أنه يزيد من خطر الإصابة بسرطان المعدة ، بسبب تحفيز الاستجابة الالتهابية المزمنة في المعدة. [97] [98]

مرض التهاب الأمعاء تحرير

يتكون مرض التهاب الأمعاء من مرضين مختلفين: التهاب القولون التقرحي ومرض كرون وكلاهما يصاحبه اضطرابات في ميكروبيوتا الأمعاء (المعروف أيضًا باسم دسباقتريوز). يظهر خلل التنسج هذا في شكل انخفاض التنوع الميكروبي في القناة الهضمية ، [99] [100] ويرتبط بعيوب في جينات المضيف التي تغير الاستجابة المناعية الفطرية لدى الأفراد. [99]

تحرير فيروس نقص المناعة البشرية

يؤثر تطور مرض فيروس العوز المناعي البشري على تكوين ووظيفة ميكروبيوتا الأمعاء ، مع وجود اختلافات ملحوظة بين السكان غير المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية ، والإيجابيين لفيروس نقص المناعة البشرية ، والمصابين بفيروس نقص المناعة البشرية بعد العلاج المضاد للفيروسات القهقرية. [ بحاجة لمصدر يقلل فيروس نقص المناعة البشرية من سلامة وظيفة الحاجز الظهاري للأمعاء من خلال التأثير على الوصلات الضيقة. يسمح هذا الانهيار بالانتقال عبر ظهارة الأمعاء ، والذي يُعتقد أنه يساهم في زيادة الالتهابات التي تظهر لدى الأشخاص المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية. [101]

تلعب الجراثيم المهبلية دورًا في إصابة فيروس نقص المناعة البشرية ، مع زيادة خطر العدوى والانتقال عندما تكون المرأة مصابة بالتهاب المهبل البكتيري ، وهي حالة تتميز بتوازن غير طبيعي للبكتيريا المهبلية. [102] يُلاحظ تحسن العدوى مع زيادة السيتوكينات المؤيدة للالتهابات وخلايا CCR5 + CD4 + في المهبل. ومع ذلك ، لوحظ انخفاض في العدوى مع زيادة مستويات المهبل اكتوباكيللوس ، مما يعزز حالة مضادة للالتهابات. [101]

تحرير الموت

مع الموت ، ينهار ميكروبيوم الجسم الحي وتسمى تركيبة مختلفة من الكائنات الحية الدقيقة necrobiome يثبت نفسه كمكون نشط مهم لعملية التحلل الفيزيائي المعقدة. يُعتقد أن التغييرات المتوقعة بمرور الوقت مفيدة للمساعدة في تحديد وقت الوفاة. [103] [104]

تساءلت الدراسات التي أجريت في عام 2009 عما إذا كان الانخفاض في الكائنات الحية (بما في ذلك الحيوانات الدقيقة) نتيجة للتدخل البشري قد يعيق صحة الإنسان ، وإجراءات سلامة المستشفيات ، وتصميم المنتجات الغذائية ، وعلاج الأمراض. [105]

تشير الأبحاث الأولية إلى أن التغييرات الفورية في الكائنات الحية الدقيقة قد تحدث عندما يهاجر شخص من بلد إلى آخر ، كما هو الحال عندما استقر المهاجرون التايلانديون في الولايات المتحدة [106] أو عندما هاجر الأمريكيون اللاتينيون إلى الولايات المتحدة. [107] كانت الخسائر في تنوع الكائنات الحية الدقيقة أكبر في الأفراد الذين يعانون من السمنة المفرطة وأطفال المهاجرين. [106] [107]


الميكروبيوم في التهاب البروستاتا وسرطان البروستاتا

قد يؤثر الميكروبيوم البشري على بدء سرطان البروستاتا و / أو تقدمه من خلال التفاعلات المباشرة وغير المباشرة. حتى الآن ، ركزت غالبية الدراسات على التفاعلات المباشرة بما في ذلك تأثير عدوى البروستاتا على خطر الإصابة بسرطان البروستاتا ، ومؤخرا ، على تكوين الميكروبيوم البولي فيما يتعلق بسرطان البروستاتا. من غير المفهوم جيدًا التفاعلات غير المباشرة للميكروبيوم مع سرطان البروستاتا ، مثل تأثير الجراثيم المعدية المعوية أو الفموية على التمثيل الغذائي للأجانب الحيوي المؤيد أو المضاد للسرطان ، والاستجابة للعلاج.

أساليب

نقوم بمراجعة الأدبيات حتى الآن حول التفاعلات المباشرة وغير المباشرة للميكروبيوم مع التهاب البروستاتا وسرطان البروستاتا.

نتائج

تشير الدراسات الناشئة إلى أن الميكروبيوم يمكن أن يؤثر على التهاب البروستاتا فيما يتعلق بأمراض البروستاتا الحميدة مثل التهاب البروستاتا / متلازمة آلام الحوض المزمنة وتضخم البروستاتا الحميد ، وكذلك في سرطان البروستاتا. نحن نقدم دليلًا على أن الميكروبيوم البشري الموجود في مواقع تشريحية متعددة (المسالك البولية ، الجهاز الهضمي ، تجويف الفم ، إلخ) قد يلعب دورًا مهمًا في صحة البروستاتا ومرضها.

الاستنتاجات

في الصحة ، يشجع الميكروبيوم على التوازن ويساعد في تثقيف جهاز المناعة. في دسباقتريوز ، قد تحدث حالة التهابية جهازية ، مما يهيئ المواقع التشريحية البعيدة للمرض ، بما في ذلك السرطان. قد تكون قدرة الميكروبيوم على التأثير على مستويات الهرمونات الجهازية مهمة أيضًا ، لا سيما في مرض مثل سرطان البروستاتا الذي يتأثر بشكل مزدوج بمستويات الإستروجين والأندروجين. نظرًا لتعقيد الترابط المحتمل بين سرطان البروستاتا والميكروبيوم ، فمن الضروري مواصلة استكشاف وفهم العلاقات ذات الصلة.


أمثلة على النباتات الطبيعية في المواضيع التالية:

الجراثيم والفلافوباكتيريوم

  • وجود البكتيريا في عاديالنباتية من الثدييات يشير إلى دورها في معالجة الجزيئات المعقدة إلى جزيئات أبسط يمكن أن يستخدمها المضيف.
  • دور البكتيريا في عاديالنباتية يتجاوز قدرتها على تحطيم الجزيئات المعقدة الأكبر ويمكن أن تظهر وظيفة الحماية.
  • وصف دور Bacteroides في عاديالنباتية الجهاز الهضمي البشري ودور فلافوباكتريوم في التسبب في المرض في أسماك المياه العذبة

الجراثيم البولي التناسلي الطبيعي

  • تلك التي من المتوقع أن تكون حاضرة وتلك تحت عادي الظروف لا تسبب المرض ، ولكن بدلا من ذلك المشاركة في الحفاظ على الصحة ، تعتبر أعضاء في عاديالنباتية.
  • دورهم يشكل جزءا من عاديومع ذلك ، فسيولوجيا الإنسان السليمة ، إذا زادت أعداد الميكروبات عن نطاقاتها النموذجية (غالبًا بسبب ضعف الجهاز المناعي) أو إذا كانت الميكروبات تسكن مناطق غير نمطية من الجسم (مثل سوء النظافة أو الإصابة) ، فقد ينتج عن ذلك المرض.
  • طبيعيالنباتية يمكن أن تعمل البكتيريا كمسببات الأمراض الانتهازية في أوقات انخفاض المناعة. تتكون البكتيريا المهبلية في الغالب من أنواع مختلفة من العصيات اللبنية.
  • اضطراب في المهبل النباتية يمكن أن يؤدي إلى التهاب المهبل الجرثومي.

المقاومة الفطرية

  • تلك التي من المتوقع أن تكون حاضرة ، وتلك تحت عادي الظروف لا تسبب المرض ، ولكن بدلا من ذلك المشاركة في الحفاظ على الصحة ، تعتبر أعضاء في عاديالنباتية.
  • دورهم يشكل جزءا من عادي، فسيولوجيا الإنسان الصحية.
  • طبيعيالنباتية يمكن أن تعمل البكتيريا كممرضات انتهازية في أوقات انخفاض المناعة.
  • عدد قليل من البكتيريا بشكل طبيعي موجود في الملتحمة.
  • القناة الهضمية النباتية هو الإنسان النباتية من الكائنات الحية الدقيقة التي بشكل طبيعي يعيشون في الجهاز الهضمي ويمكنهم أداء عدد من الوظائف المفيدة لمضيفيهم.

الجراثيم الطبيعية للعين

  • عدد قليل من البكتيريا بشكل طبيعي موجود في الملتحمة.
  • تلك التي من المتوقع أن تكون موجودة ولا تسبب المرض (تحت عادي الظروف) ، ولكنهم بدلاً من ذلك يشاركون في الحفاظ على الصحة ، يعتبرون أعضاء في عاديالنباتية.
  • عدد قليل من البكتيريا بشكل طبيعي موجود في الملتحمة.
  • أعط أمثلة على الكائنات الحية الدقيقة الموجودة في عادي ميكروبيوتا العين

أمراض الجلد البكتيرية

  • بينما تختفي أعراض المرض في غضون يوم أو يومين ، قد يستغرق الجلد أسابيع للعودة إليه عادي.
  • يمكن أن يكون سبب التهاب النسيج الخلوي عادي جلد النباتية أو عن طريق البكتيريا الخارجية ، وغالبًا ما يحدث في الأماكن التي تم فيها كسر الجلد سابقًا.
  • تعد المكورات العقدية من المجموعة أ والمكورات العنقودية أكثر أنواع البكتيريا شيوعًا ، والتي تعد جزءًا من عاديالنباتية من الجلد ، ولكن بشكل طبيعي لا تسبب أي عدوى فعلية على السطح الخارجي للجلد.

اختراق دفاعات المضيف

  • الكائنات التي من المتوقع أن تكون موجودة ، وتلك الموجودة تحت عادي الظروف لا تسبب المرض ، ولكن المشاركة في الحفاظ على الصحة ، تعتبر أعضاء في عاديالنباتية.
  • العديد من البكتيريا الموجودة في الجهاز الهضمي ، يشار إليها مجتمعة باسم الأمعاء النباتية، قادرة على تكسير بعض العناصر الغذائية مثل الكربوهيدرات التي لا يستطيع البشر هضمها.
  • طبيعيالنباتية يمكن أن تعمل البكتيريا كممرضات انتهازية في أوقات انخفاض المناعة.

الجراثيم المعدية المعوية الطبيعية

  • القناة الهضمية النباتية تتكون من كائنات دقيقة تعيش في المسالك الهضمية للحيوانات وهي أكبر خزان للإنسان النباتية.
  • القناة الهضمية النباتية يتكون من كائنات دقيقة تعيش في المسالك الهضمية للحيوانات وهي أكبر خزان للإنسان النباتية .
  • ويقدر أن هذه القناة الهضمية النباتية لديها حوالي 100 ضعف عدد الجينات في المجموع كما هو الحال في الجينوم البشري.
  • تشكل البكتيريا معظم النباتية في القولون وما يصل إلى 60٪ من كتلة البراز الجافة.
  • تشكل الفطريات والأوليات أيضًا جزءًا من القناة الهضمية النباتية، ولكن لا يُعرف الكثير عن أنشطتهم.

قمع وتغيير الجراثيم بواسطة مضادات الميكروبات

  • يستضيف جسم الإنسان آلاف الأنواع المختلفة من الكائنات الحية الدقيقة المعروفة باسم الميكروبات النباتية أو ميكروبيوتا.
  • مثال على ذلك هو القناة الهضمية النباتية الدخول في مجرى الدم في الجسم.
  • في حالة القناة الهضمية النباتية، قد يضعف هذا من قدرة المريض على استقلاب الطعام بشكل صحيح.
  • بالإضافة إلى أنها تؤدي وظيفة ضرورية مثل القناة الهضمية النباتية بسبب عملية التمثيل الغذائي للطعام ، فإن بعض الكائنات الحية الدقيقة في أجسامنا تخدم وظيفة منع الميكروبات المسببة للأمراض من السكن أو السيطرة على الآخرين النباتية في مواقع في أجسامنا.
  • C. البيض هو بشكل طبيعي غير ضار ، ولكن عندما تتناول النساء بعض المضادات الحيوية ، يمكن أن يقتل ذلك البكتيريا المفيدة ، وتحديداً العصيات اللبنية ، في منطقة الفرج والمهبل.

السيطرة على التهابات المستشفيات

  • يمكن أن توجد فئتان من الكائنات الحية الدقيقة على أيدي العاملين في مجال الرعاية الصحية: عابرة النباتية ومقيم النباتية.
  • الميكروبات التي يتألف منها الساكن النباتية هي: Staphylococcus epidermidis و S. hominis و Microccocus و Propionibacterium و Corynebacterium و Dermobacterium و Pitosporum spp. بينما في المرحلة الانتقالية يمكن العثور على S. aureus و Klebsiella pneumoniae و Acinetobacter و Enterobacter و Candida spp.
  • الهدف من نظافة اليدين هو القضاء على العابر النباتية مع أداء دقيق وسليم لغسل اليدين ، باستخدام أنواع مختلفة من الصابون ، على حد سواء عادي ومطهر ، والمواد الهلامية التي تحتوي على الكحول.

نظرة عامة على التفاعلات البشرية الميكروبية

  • القناة الهضمية النباتية يتكون من كائنات دقيقة تعيش في المسالك الهضمية للحيوانات وهي أكبر خزان للإنسان النباتية.
  • تشكل البكتيريا معظم النباتية في القولون وما يصل إلى 60٪ من كتلة البراز الجافة.
  • تشكل الفطريات والأوليات أيضًا جزءًا من القناة الهضمية النباتية، ولكن لا يُعرف الكثير عن أنشطتهم.
  • جلد النباتية عادة ما تكون غير مسببة للأمراض وإما متكافئة أو متبادلة.
  • مسببات الأمراض الأولية تسبب المرض نتيجة لوجودها أو نشاطها داخل عادي، مضيف صحي.
المواضيع
  • محاسبة
  • الجبر
  • تاريخ الفن
  • مادة الاحياء
  • عمل
  • حساب التفاضل والتكامل
  • كيمياء
  • مجال الاتصالات
  • اقتصاديات
  • تمويل
  • إدارة
  • تسويق
  • علم الاحياء المجهري
  • الفيزياء
  • علم وظائف الأعضاء
  • العلوم السياسية
  • علم النفس
  • علم الاجتماع
  • إحصائيات
  • تاريخ الولايات المتحدة
  • تاريخ العالم
  • كتابة

باستثناء ما هو مذكور ، المحتوى ومساهمات المستخدم على هذا الموقع مرخصة بموجب CC BY-SA 4.0 مع الإسناد المطلوبة.


داء اللولبيات الأخرى

الداء العليقي ، بسبب تي الشاحبة subsp بيرنيو، يسود في المناطق الاستوائية في أفريقيا وأمريكا الجنوبية والهند وإندونيسيا وجزر المحيط الهادئ. يشار إلى طبيعتها شديدة العدوى من خلال ما يقدر بنحو 50 مليون حالة في جميع أنحاء العالم. يحدث الانتقال من خلال الاتصال غير الجنسي بين البشر. معظم الحالات عند الأطفال والمراهقين. في المناطق الموبوءة ، يصاب 75 في المائة من السكان بمرض الداء العليقي قبل بلوغهم العشرين من العمر.

تظهر الآفة الأولية ، أو الانعراج الأم ، في غضون 2 إلى 4 أسابيع في موقع دخول الجلد على شكل حطاطة حمامية غير مؤلمة أو مجموعة من الحطاطات. تتضخم الآفات وتتقرح ، مما يؤدي إلى نضح سائل مصلي مع صبغة دموية مليئة بالكائنات الحية. تلتئم هذه الآفات في غضون شهر إلى عدة أشهر ، تاركة ندبة ضامرة مكتئبة. تنتشر اللولبيات ، وفي غضون شهر إلى 12 شهرًا ، تتطور الآفات الثانوية التي تشبه إلى حد بعيد الانعراج الأم. تتطور محاصيل هذه الآفات في البداية على الوجه والمناطق الرطبة من الجسم ثم تنتشر إلى الجذع والذراعين. تعد الإصابة في باطن اليد وراحة اليد مميزة ، كما هو الحال في مرض الزهري. قد تتضخم الحطاطات الحبيبية المرتفعة إلى قطر 5 سم ثم تلتئم ، تاركة مناطق تصبغ. تحدث المحاصيل المتتالية من هذه الآفات لعدة أشهر. علم التشريح المرضي مشابه لتلك التي لوحظت في مرض الزهري ، مع الحد الأدنى من التغيرات الوعائية وعدم تكاثر الخلايا البطانية. تتضمن المرحلة التدميرية المتأخرة ، التي تسمى أحيانًا الداء العليقي العالي ، عدوى لولبية في العظام والسمحاق ، وخاصة العظام الطويلة للساقين والقدمين ، وعظام القدمين واليدين. النتائج المرضية مماثلة لتلك التي شوهدت في المرحلة الثالثة من مرض الزهري. قد تحدث الصمغ شديد التدمير أيضًا داخل العظام والأنسجة الرخوة. يعتمد التشخيص على الموقع الجغرافي ، والمظاهر السريرية ، وإظهار اللولبيات داخل الإفرازات ، والأمصال الإيجابية. في المناطق التي يتعايش فيها مرض الزهري والداء العليقي ، يكون التشخيص النهائي غير ضروري حيث يمكن القضاء على كليهما بسهولة بواسطة البنسلين.

بينتا

بينتا ، بسبب تي قيراط، مستوطن في المناطق الاستوائية في أمريكا الوسطى والجنوبية. في الآونة الأخيرة ، قُدِّر العدد الإجمالي للحالات بنحو 500000 حالة. يحدث الانتقال من خلال الاتصال غير الجنسي بين البشر. تحدث معظم الحالات في البداية عند الأطفال والمراهقين.

تتطور الآفة الأولية في غضون 2 إلى 6 أشهر في موقع دخول الجلد على شكل حطاطة حمامية مسطحة أو مجموعة حطاطات. تتضخم هذه الآفات وآفات الأقمار الصناعية العرضية على مدى عدة أشهر وتنتج لويحات ذات أسطح متقشرة. تحدث الآفات الثانوية بعد شهرين إلى 18 شهرًا أو أكثر وتنطوي على تقرحات وبقع مفرطة الصبغيات. عادة ما تكون اليدين والقدمين وفروة الرأس مصابة بالعدوى. تتضمن المراحل المتأخرة من البنتا بقعًا من فرط الصبغية والألوان ، والشواك غير المنتظم ، وضمور البشرة. تلتئم الآفات في البداية مع فرط تصبغ ولكن بمرور الوقت تصبح ناقصة التصبغ وفرط التقرن بسبب الندوب. تزعج اللولبيات تصبغ الميلانين الطبيعي وتنتج مظاهر جلدية مميزة في غضون 2 إلى 5 سنوات.

لم يتم فصل المراحل المختلفة لهذا المرض بشكل واضح ، وتداخل المظاهر شائع. يعتمد التشخيص على الموقع الجغرافي والمظاهر السريرية وإظهار الكائنات الحية في الإفرازات والأمصال الإيجابية. البنسلين هو المضاد الحيوي المفضل. على عكس مرض الزهري والداء العليقي ، حيث تلتئم الآفات بسرعة بعد العلاج بالمضادات الحيوية ، قد تتطلب آفات البنتا سنة واحدة لحلها بشكل كامل. بعد المظاهر الأولية أو الثانوية المبكرة ، يعود تصبغ الجلد إلى طبيعته. ومع ذلك ، في المظاهر اللاحقة ، يظل التصبغ متغيرًا بشكل دائم.

مرض الزهري المتوطن

الزهري المستوطن ، يسببه تي الشاحبة subsp المتوطنة، توجد في المناطق الصحراوية في الشرق الأوسط ووسط وجنوب إفريقيا. يتم الانتقال من خلال الاتصال غير الجنسي بين البشر. معظم الحالات يصاب بها الأطفال بعد سن السنتين. يرتبط انتقال مرض الزهري المستوطن ، مثله مثل الداء العليقي والبنتا ، بسوء النظافة. يمكن أن تكون المظاهر السريرية مشابهة تمامًا لمرض الزهري والداء العليقي. عادة ما يكون موقع الدخول هو الأغشية المخاطية للعينين والفم. يمكن اكتشاف الآفة الأولية ، وهي حطاطة صغيرة ، في واحد بالمائة فقط من الحالات. بعد شهرين إلى ثلاثة أشهر ، تظهر آفات ثانوية أو لويحات في الأغشية المخاطية والجلد والعضلات والعظام. تتآكل هذه الحطاطات النازية ، وتتصلب ، وتصبح لقمية ، وتشفى في النهاية. ثم لا تظهر المظاهر السريرية لمدة 5 إلى 15 سنة (الكمون). يتطور مرض الزهري المتوطن المتأخر في الجلد والجهاز الهيكلي. قد تكون الآفات الجلدية سطحية ، أو عقيدية ، أو حدنية ، أو قد تكون شديدة التدمير ، وصمغ عميق. كثيرا ما تتوضع آفات العظام المدمرة في الظنبوب. يعتمد التشخيص على الموقع الجغرافي والمظاهر السريرية واللولبيات في الإفرازات والأمصال الإيجابية. البنسلين يقضي على مرض الزهري المتوطن.



تعليقات:

  1. Zululkis

    في هذا شيء.

  2. Ektibar

    هذا الأمر من يديك!

  3. Suzu

    الجواب الصحيح

  4. Zolonris

    موضوع فضولي للغاية

  5. Drue

    أدخل سنتحدث.



اكتب رسالة